RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.53■■□□□ 1.52
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SLC25A39-201ENST00000225308 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.53■■□□□ 1.52
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SLC25A39-201ENST00000225308 BACH1O14867 736 aa24.52■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 PSAPP07602 524 aa24.52■■□□□ 1.52
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SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF302Q9NR11 478 aa24.52■■□□□ 1.52
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SLC25A39-201ENST00000225308 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.51■■□□□ 1.51
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SLC25A39-201ENST00000225308 FAM160B1Q5W0V3 765 aa24.5■■□□□ 1.51
SLC25A39-201ENST00000225308 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.5■■□□□ 1.51
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SLC25A39-201ENST00000225308 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.5■■□□□ 1.51
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SLC25A39-201ENST00000225308 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SLC25A39-201ENST00000225308 PLCB4Q15147 1175 aa24.49■■□□□ 1.51
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SLC25A39-201ENST00000225308 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.49■■□□□ 1.51
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.48■■□□□ 1.51
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF862O60290 1169 aa24.48■■□□□ 1.51
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
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SLC25A39-201ENST00000225308 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SLC25A39-201ENST00000225308 SETD4Q9NVD3 440 aa24.48■■□□□ 1.51
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SLC25A39-201ENST00000225308 H0YGN5 161 aa24.46■■□□□ 1.51
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SLC25A39-201ENST00000225308 PPFIA1Q13136 1202 aa24.46■■□□□ 1.51
SLC25A39-201ENST00000225308 POTEBQ6S5H4 581 aa24.46■■□□□ 1.51
SLC25A39-201ENST00000225308 TRPC6Q9Y210 931 aa24.46■■□□□ 1.51
SLC25A39-201ENST00000225308 NRCAMQ92823 1304 aa24.46■■□□□ 1.51
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SLC25A39-201ENST00000225308 CYP2C9P11712 490 aa24.46■■□□□ 1.51
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SLC25A39-201ENST00000225308 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
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SLC25A39-201ENST00000225308 PRPHP41219 470 aa24.44■■□□□ 1.5
SLC25A39-201ENST00000225308 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.52e-7■□□□□ 8.4
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SLC25A39-201ENST00000225308 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.44■■□□□ 1.5
SLC25A39-201ENST00000225308 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SLC25A39-201ENST00000225308 RGL1Q9NZL6 768 aa24.44■■□□□ 1.5
SLC25A39-201ENST00000225308 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SLC25A39-201ENST00000225308 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa24.44■■□□□ 1.5
SLC25A39-201ENST00000225308 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.43■■□□□ 1.5
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SLC25A39-201ENST00000225308 IL17AQ16552 155 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC25A39-201ENST00000225308 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
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