RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000057254.5

Ubqln3-201, Transcript of Ubiquilin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubqln3, Length 2,376 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 PurbO35295 324 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Irf6P97431 467 aa9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Dcaf17Q3TUL7 519 aa9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Map3k9Q3U1V8 1077 aa9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Kif5bQ61768 963 aa9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tlr13Q6R5N8 991 aa9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Haus4Q8BFT2 363 aa9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tbc1d10cQ8C9V1 444 aa9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Q8CEZ4 452 aa9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Srgap2Q91Z67 1071 aa9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Usp31E9Q6Y8 1344 aa9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 1700016G14RikA0A286YCZ6 238 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm4907B1AXB9 411 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Trappc11B2RXC1 1133 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm3043K7N693 218 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm16440K7N6G6 218 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm2244L7N2A3 218 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm3278L7N2D2 218 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm8271L7N2E2 218 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 MyocO70624 490 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mier3Q3UHF3 551 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ankrd13cQ3UX43 541 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Atp13a4Q5XF90 1193 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mettl25Q6NXH8 597 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Asic3Q6X1Y6 530 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pank4Q80YV4 820 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Iqcb1Q8BP00 598 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Maats1Q8BRC6 783 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mrgprx1Q8CIP3 322 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Bco2Q99NF1 532 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Eef1gQ9D8N0 437 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Klra17Q9JMA4 273 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Trp53inp1Q9QXE4 239 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ripor3A1L3T7 938 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Skint3A7TZF0 458 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cyp2c68K7N6C2 491 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm4758L7N258 96 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Nfatc2ipO09130 412 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Kcnh2O35219 1162 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pip4k2aO70172 405 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 P4hbP09103 509 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 PtpraP18052 829 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fgfr4Q03142 799 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Sema4bQ62179 823 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tpm4Q6IRU2 248 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 BcrQ6PAJ1 1270 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Snd1Q78PY7 910 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fam13bQ8K2H3 851 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 1700020D05RikQ99PB1 294 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fam111aQ9D2L9 613 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 PdclQ9DBX2 301 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tmod2Q9JKK7 351 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Klra10Q9R1G6 266 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fem1bQ9Z2G0 627 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fam205aA2APU8 1308 aa9.75□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 1700018F24RikB2RW27 314 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Zfp408H7BX78 710 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 L1camP11627 1260 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tcerg1lQ3B807 590 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Lrrn2Q6PHP6 730 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Stap2Q8R0L1 411 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Vps33aQ9D2N9 598 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fam187aQ9D3R5 417 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cry2Q9R194 592 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Hebp1Q9R257 190 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Scn10aQ6QIY3 1958 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mms22lB1AUR6 1238 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gcom1E9PZ54 550 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 AunipE9Q6Z5 340 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Sema4dO09126 861 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 MyzapQ3UIJ9 466 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Rsad1Q5SUV1 442 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Hdac10Q6P3E7 666 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 TbataQ7TSD4 393 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cog5Q8C0L8 829 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Hgh1Q8C3I8 393 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Phldb2Q8K1N2 1249 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Dnajc17Q91WT4 303 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Creb3l3Q91XE9 479 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Rrp1bQ91YK2 724 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Plagl2Q925T4 496 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 PycardQ9EPB4 193 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ddx25Q9QY15 484 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Trim10Q9WUH5 489 aa9.74□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm45194A0A140LJG2 572 aa9.73□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 TazI7HJS2 263 aa9.73□□□□□ -0.85
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Barx2O08686 283 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14 ms