RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa25.57■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zmynd15Q8C0R7 736 aa25.57■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr397Q8VEZ6 315 aa25.57■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TtpalQ9D3D0 343 aa25.57■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asah2Q9JHE3 756 aa25.57■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa25.57■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eif2ak1Q9Z2R9 619 aa25.57■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abcb11Q9QY30 1321 aa25.57■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam124aD3Z5V4 536 aa25.56■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Il1rapl1P59823 695 aa25.56■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hoxb13P70321 286 aa25.56■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Irf3P70671 419 aa25.56■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cnnm4Q69ZF7 771 aa25.56■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb5Q7TQG0 670 aa25.56■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdca8Q8BHX3 289 aa25.56■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Akirin1Q99LF1 191 aa25.56■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Diaph1O08808 1255 aa25.55■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wnt7aP24383 349 aa25.55■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa25.55■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnj11Q61743 390 aa25.55■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ifit1Q64282 463 aa25.55■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MylipQ8BM54 445 aa25.55■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa25.55■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nemp2Q8CB65 421 aa25.55■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mcoln1Q99J21 580 aa25.55■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myh9Q8VDD5 1960 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc39a2G3X943 309 aa25.54■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PrkceP16054 737 aa25.54■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd86P42082 309 aa25.54■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nfe2Q07279 373 aa25.54■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hhla1Q3TYV2 514 aa25.54■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa25.54■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem202Q80W35 275 aa25.54■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 F13a1Q8BH61 732 aa25.54■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa25.54■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Spred2Q924S7 410 aa25.54■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbc1d2B1AVH7 922 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 UgcgO88693 394 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Psmc5P62196 406 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc55Q3UY51 311 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P3h1Q3V1T4 739 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gas6Q61592 674 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tgoln2Q62314 363 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gemin4Q6P6L6 1058 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sestd1Q80UK0 696 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PisdQ8BSF4 406 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ClmnQ8C5W0 1052 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdhb12Q91Y07 789 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grin3bQ91ZU9 1003 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AacsQ9D2R0 672 aa25.53■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp213E9QAW0 468 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Capn2O08529 700 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccr1P51675 355 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PklrP53657 574 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q5XFZ0 217 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Epha7Q61772 998 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Crb2Q80YA8 1282 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ano1Q8BHY3 960 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nod2Q8K3Z0 1020 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ces4aQ8R0W5 563 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim29Q8R2Q0 587 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tspyl4Q8VD63 406 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prb1Q91X93 504 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr64Q9D565 1086 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Drc3Q9D5E4 523 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stxbp4Q9WV89 557 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mtmr1Q9Z2C4 669 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gon4lQ9DB00 2260 aa25.52■■□□□ 1.68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgef26D3YYY8 869 aa25.51■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnma1Q08460 1209 aa25.51■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Psg29Q3URN6 468 aa25.51■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc17a8Q8BFU8 601 aa25.51■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam49aQ8BHZ0 323 aa25.51■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Larp6Q8BN59 492 aa25.51■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Neu4Q8BZL1 478 aa25.51■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mkrn2Q9ERV1 416 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GdaQ9R111 454 aa25.51■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem131O70472 1877 aa25.51■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3252E9PUT9 216 aa25.5■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3468E9QAJ8 216 aa25.5■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Svs3aF2Z472 265 aa25.5■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tap2P36371 702 aa25.5■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tulp2P46686 562 aa25.5■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SPINDOCQ05AH6 381 aa25.5■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mettl14Q3UIK4 456 aa25.5■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 C87499Q3UX49 493 aa25.5■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Inppl1Q6P549 1257 aa25.5■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa25.5■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lama3Q61789 3330 aa25.49■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pbx2O35984 430 aa25.49■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Apba3O88888 571 aa25.49■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dpf3P58269 378 aa25.49■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rufy4Q3TYX8 563 aa25.49■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp6v0d2Q80SY3 350 aa25.49■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pnma1Q8C1C8 353 aa25.49■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24 ms