RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	KKQ8	P36004	724 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	YBP1	P38315	674 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	YHR218W	P38899	603 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	MLH1	P38920	769 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	FAA2	P39518	744 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	YIL067C	P40514	678 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	GOR1	P53839	350 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	HXT11	P54862	567 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	MEH1	Q02205	184 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	PDE2	P06776	526 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	ALG1	P16661	449 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	YKL097C	P34245	136 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	RIB5	P38145	238 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	INM1	P38710	295 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	AZR1	P50080	613 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	ROG1	P53118	685 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	RUP1	Q12242	671 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	PFF1	P38244	976 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	SIM1	P40472	476 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	YMR181C	Q03231	154 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	PPM1	Q04081	328 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	NDL1	Q06568	189 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	CDC21	P06785	304 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	SPS22	P25380	463 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	PHO91	P27514	894 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YBR056W	P38081	501 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	NCA3	P46955	337 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	PIB2	P53191	635 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	STD1	Q02794	444 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	DST1	P07273	309 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	CPR4	P25334	318 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	CPR3	P25719	182 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.89	□□□□□ -1.79	not detected
RPC17	YJL011C	QDR3	P38227	689 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	MTC6	P38849	526 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YFL067W	P43537	175 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	BOR1	P53838	576 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YPL107W	Q02873	248 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YDR541C	Q03049	344 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	MMT1	Q03218	510 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	ESA1	Q08649	445 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	RNH203	Q12338	110 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	FRE6	Q12473	712 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	MSP1	P28737	362 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YSC83	P32792	385 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YBR139W	P38109	508 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YSW1	P38280	609 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	MLC1	P53141	149 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	BCH1	Q05029	724 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	NSE1	Q07913	336 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YLR108C	Q12259	485 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	TRP1	P00912	224 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	JLP2	P40206	208 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	PRM5	P40476	318 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	SFH5	P47008	294 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	BRO1	P48582	844 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	TOS2	P50078	622 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	PMT5	P52867	743 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	TLG2	Q08144	397 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	NFI1	Q12216	726 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	ERV2	Q12284	196 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	SPT7	P35177	1332 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	OPI3	P05375	206 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	DAP2	P18962	818 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	OPI1	P21957	404 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	SKN1	P33336	771 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	MRPL4	P36517	319 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	MNL1	P38888	796 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YIP5	P53108	310 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	TOF1	P53840	1238 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	PBA1	Q05778	276 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	SKS1	Q12505	502 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	CYC3	P06182	269 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	AVT5	P38176	459 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	PAC11	P40960	533 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	EOS1	P53938	366 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YOR387C	Q08910	206 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	NCA2	Q12374	616 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YCL068C	P25593	260 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	CHK1	P38147	527 aa		3.84	□□□□□ -1.79

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