RNA–Protein interactions for RNA: YGL145W

TIP20, Transcript of Peripheral membrane protein required for COPI vesicle fusion to the ER, yeast

Gene TIP20, Length 2,106 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIP20	YGL145W	COT1	P32798	439 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	ALP1	P38971	573 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RTT102	P53330	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	SEG1	Q04279	960 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	ECM7	Q06200	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	CAT8	P39113	1433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	NTE1	Q04958	1679 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	CDC21	P06785	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RNQ1	P25367	405 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	NTG1	P31378	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	HMX1	P32339	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	MRP4	P32902	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	PEX18	P38855	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	TRS85	P46944	698 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	PMT5	P52867	743 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YGL114W	P53134	725 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	RRG8	Q06109	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	PEX27	Q08580	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIP20	YGL145W	BI2	P03873	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	BUD2	P33314	1104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	ARN1	P38731	627 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	YHR122W	P38829	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	TMN2	Q04562	672 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	RDR1	Q08904	546 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	RUP1	Q12242	671 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	NUP159	P40477	1460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	GID7	P25569	745 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	FRE1	P32791	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	ATM1	P40416	690 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	SPG5	P42933	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	RHO4	Q00246	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	URC2	Q04411	772 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	IMA2	Q08295	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	BUG1	Q12191	341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	OPI3	P05375	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	YPS1	P32329	569 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	YBL028C	P38202	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	LAG1	P38703	411 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	STB4	P50104	949 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	VOA1	P53262	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	ARR1	Q06596	294 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	SAC3	P46674	1301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	SPS22	P25380	463 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	SDS3	P40505	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	SOL4	P53315	255 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	YNL146W	P53906	100 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	SRB8	P25648	1427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	RAD57	P25301	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	UTR4	P32626	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	REC114	P32841	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	KKQ8	P36004	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	PHO90	P39535	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	FAU1	P40099	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	TOS3	P43637	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	BIO3	P50277	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	TAF12	Q03761	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	NUP53	Q03790	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	URH1	Q04179	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	AFT2	Q08957	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	PFA4	Q12006	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIP20	YGL145W	ACF2	Q12168	779 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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