RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIM50Q86XT4 487 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 MXRA8Q9BRK3 442 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 ANO3Q9BYT9 981 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 SETD4Q9NVD3 440 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 UNC80Q8N2C7 3258 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 NID2Q14112 1375 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 SCG2P13521 617 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 MBTPS1Q14703 1052 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 MCTP2Q6DN12 878 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 AGXT2Q9BYV1 514 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 ERAP1Q9NZ08 941 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRVP-204ENST00000639439 GBF1Q92538 1859 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ESYT2A0FGR8 921 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 TLL1O43897 1013 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 IGFBP4P22692 258 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 SREBF1P36956 1147 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ADAM17P78536 824 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ARHGAP4P98171 946 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ADGRE1Q14246 886 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 CEP55Q53EZ4 464 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 LMBR1Q8WVP7 490 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 GLG1Q92896 1179 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 SDF4Q9BRK5 362 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 KCNH7Q9NS40 1196 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 PKD2L1Q9P0L9 805 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 TELO2Q9Y4R8 837 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 NFASCO94856 1347 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 TAF2Q6P1X5 1199 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 NIPA1Q7RTP0 329 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ZBED2Q9BTP6 218 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC9A2Q9UBY0 812 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 EYSQ5T1H1 3165 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 DOCK5Q9H7D0 1870 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 MEIS1O00470 390 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 GJB5O95377 273 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 GNA11P29992 359 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF76P36508 570 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 EVCP57679 992 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 DEFB103AP81534 67 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 TAP1Q03518 808 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 PPFIA1Q13136 1202 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 RPAINQ86UA6 219 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 USP38Q8NB14 1042 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 DBF4BQ8NFT6 615 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 SEPT8Q92599 483 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 PGBD1Q96JS3 809 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 RAD9AQ99638 391 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ZMYND12Q9H0C1 365 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 AZI2Q9H6S1 392 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 C6orf50Q9HD87 102 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 CHD7Q9P2D1 2997 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 TCTN1Q2MV58 587 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM26DQ5JW98 314 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 RUFY3Q7L099 469 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 RSPH3Q86UC2 560 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 CYP2W1Q8TAV3 490 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM260Q9NX78 707 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 RRN3P2A6NIE6 340 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 AMHP03971 560 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 CYP3A4P08684 503 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 CTSHP09668 335 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ARP10275 920 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 IFNAR1P17181 557 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 MARK3P27448 753 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 GRIK4Q16099 956 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 PKN1Q16512 942 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ERICH6BQ5W0A0 696 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC148Q8NFR7 591 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 BICD2Q8TD16 824 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 PPM1EQ8WY54 764 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 APBB2Q92870 758 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 TM6SF1Q9BZW5 370 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 TUBE1Q9UJT0 475 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 KAT6AQ92794 2004 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ACTR2P61160 394 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 NTRK3Q16288 839 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRVP-204ENST00000639439 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms