RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628368.1

CPS1-IT1-201, CPS1 intronic transcript 1, humanhuman

BASIC

Gene CPS1-IT1, Length 2,306 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-IT1-201ENST00000628368 RGS20O76081 388 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 FCER1AP12319 257 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CYP11B2P19099 503 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PAK1Q13153 545 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 EPHA7Q15375 998 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 GPBP1Q86WP2 473 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TPH2Q8IWU9 490 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 DRC7Q8IY82 874 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 NELFBQ8WX92 580 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 HPS3Q969F9 1004 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 DYDC2Q96IM9 177 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 FBXO40Q9UH90 709 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PFASO15067 1338 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 MAFGO15525 162 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 EYA4O95677 639 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 IDEP14735 1019 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 MUTP22033 750 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 UBASH3AP57075 661 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CNTN2Q02246 1040 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 Q3C1V9 767 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 DNERQ8NFT8 737 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 GPRASP2Q96D09 838 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 IWS1Q96ST2 819 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PANK4Q9NVE7 773 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 WDR70Q9NW82 654 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ASTN1O14525 1302 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SOCS7O14512 581 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PSMA7O14818 248 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ZBTB39O15060 712 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 STAM2O75886 525 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SLC25A27O95847 323 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SERPINC1P01008 464 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CETPP11597 493 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ERCC3P19447 782 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 GTF2A2P52657 109 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PSMD2Q13200 908 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 STIM1Q13586 685 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CST9Q5W186 159 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 NLRX1Q86UT6 975 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 NACC1Q96RE7 527 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ESPNB1AK53 854 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CBFA2T2O43439 604 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CCNE2O96020 404 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CYP2C8P10632 490 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 PPP1R2P41236 205 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 FSTL1Q12841 308 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 COASYQ13057 564 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 GIT2Q14161 759 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 TTI2Q6NXR4 508 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-IT1-201ENST00000628368 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms