RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 COPS5Q92905 334 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.61□□□□□ -0.87
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SGMS1-211ENST00000626236 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
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SGMS1-211ENST00000626236 CHMP2AO43633 222 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 PSMD10O75832 226 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 GH1P01241 217 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 ME1P48163 572 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 IL17AQ16552 155 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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SGMS1-211ENST00000626236 TLK2Q86UE8 772 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 FERMT2Q96AC1 680 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 RIT2Q99578 217 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 SLC9A2Q9UBY0 812 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 VAV3Q9UKW4 847 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 POTEMA6NI47 508 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 PPP6R2O75170 966 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 RARBP10826 455 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 KRT76Q01546 638 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 GRIN1Q05586 938 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 ARHGAP1Q07960 439 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 PPP2R5CQ13362 524 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 LAMC2Q13753 1193 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 METTL7BQ6UX53 244 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 SPATA33Q96N06 139 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 CLIC6Q96NY7 704 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 GBP4Q96PP9 640 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 RAB34Q9BZG1 259 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 CSRNP2Q9H175 543 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 SAMM50Q9Y512 469 aa9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 ELP1O95163 1332 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CUTAO60888 179 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R37O75864 691 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CCNE2O96020 404 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CCL5P13501 91 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 JAK3P52333 1124 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 ACTR2P61160 394 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 MTFR1Q15390 333 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 AFG1LQ8WV93 481 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 Q9Y3F1 56 aa9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PP2D1A8MPX8 630 aa9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 WDR64B1ANS9 1081 aa9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 EML1O00423 815 aa9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 MSCO60682 206 aa9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PGK1P00558 417 aa9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 MMP3P08254 477 aa9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 SFNP31947 248 aa9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
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