RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618606.1

TARDBP-220, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 2

Gene TARDBP, Length 584 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-220	ENST00000618606	COL6A1	P12109	1028 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	GRIA2	P42262	883 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	EDA	Q92838	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	MAFK	O60675	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	INHBC	P55103	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	PTH1R	Q03431	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	LMF1	Q96S06	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606		A0A1W2PQU0	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	KRIT1	O00522	736 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	MSC	O60682	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	KLHL18	O94889	574 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	GJB6	O95452	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606		Q6ZUG5	572 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606		A0A087X1B8	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	PLSCR1	O15162	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	DLX3	O60479	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	CHGB	P05060	677 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	COMT	P21964	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	EXTL1	Q92935	676 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	AGRP	O00253	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	SLC27A2	O14975	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-220	ENST00000618606	KNG1	P01042	644 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	CKM	P06732	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	FGR	P09769	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	FAH	P16930	419 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	CSF2RB	P32927	897 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	DGCR2	P98153	550 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	GRIN1	Q05586	938 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	TUSC3	Q13454	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606		Q6ZSN1	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	EPHA5	P54756	1037 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	PFKP	Q01813	784 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-220	ENST00000618606	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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