RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 MSH4O15457 936 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM86B2P0C5J1 330 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDC25AP30304 524 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 HERVK_113P62684 666 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYL5Q02045 173 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 MORC3Q14149 939 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCNB1Q14721 858 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 HYIQ5T013 277 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 IWS1Q96ST2 819 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRO3102Q9H379 93 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PXMP2Q9NR77 195 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 EXOC1Q9NV70 894 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNM3Q9UQ16 869 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PEX10O60683 326 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPN1P04843 607 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 DPCR1Q3MIW9 517 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 LUZP1Q86V48 1076 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAD54LQ92698 747 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC5A5Q92911 643 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPATC1LQ9H0A9 340 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 TXNRD2Q9NNW7 524 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 TUFT1Q9NNX1 390 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 JADE2Q9NQC1 790 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 NR2E3Q9Y5X4 410 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 EDIL3O43854 480 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 HMGCRP04035 888 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 TPM3P06753 285 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPA1P27694 616 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM32Q13049 653 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP2R5CQ13362 524 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 MTMR1Q13613 665 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PGM5Q15124 567 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM119Q4V9L6 283 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNNM4Q6P4Q7 775 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC30A10Q6XR72 485 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 NCAPG2Q86XI2 1143 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 AOPEPQ8N6M6 819 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 TAAR1Q96RJ0 339 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLIN2Q99541 437 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 C7orf25Q9BPX7 421 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PDCD2LQ9BRP1 358 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PAGR1Q9BTK6 254 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 MROH8Q9H579 483 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PARP14Q460N5 1801 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF20AO95235 890 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT18P05783 430 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRR29P0C7W0 189 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 ASIC1P78348 528 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 GRB10Q13322 594 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 IQCB1Q15051 598 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 POTEEQ6S8J3 1075 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 LENG9Q96B70 501 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPRASP2Q96D09 838 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM5Q9C035 493 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 CYP39A1Q9NYL5 469 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 RBPJLQ9UBG7 517 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 CBFA2T2O43439 604 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PSMD2Q13200 908 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCTD2Q14681 263 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 EPHA7Q15375 998 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 Q3C1V9 767 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 ISM2Q6H9L7 571 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 SHCBP1Q8NEM2 672 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIB2Q92519 343 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA1024Q9UPX6 916 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 POTEB2H3BUK9 544 aa18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 PSMD10O75832 226 aa18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 NR3C2P08235 984 aa18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 SFNP31947 248 aa18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 CUL4BQ13620 913 aa18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 STXBP2Q15833 593 aa18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 NAALADL2Q58DX5 795 aa18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC65Q8IXS2 484 aa18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms