RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449		F5H6K3	240 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	KRT14	P02533	472 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	CRK	P46108	304 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	KLRC3	Q07444	240 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	NPY5R	Q15761	445 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449		K7ENM7	598 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.97	□□□□□ -0.17	3e-6	■■□□□ 12.5
ACSS3-208	ENST00000616449	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	COPB2	P35606	906 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1W2PQC6	194 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449		H0YIN7	160 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	SLCO1A2	P46721	670 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF543	Q08ER8	600 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	MESD	Q14696	234 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	EHD4	Q9H223	541 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ACSS3-208	ENST00000616449	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	KLRC1	P26715	233 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	STIM2	Q9P246	746 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	MYB	P10242	640 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	BMP3	P12645	472 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CHRNA5	P30532	468 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC63	Q05C16	580 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC114	Q96M63	670 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	NNT	Q13423	1086 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	BIRC3	Q13489	604 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP1R7	Q15435	360 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	MYL1	P05976	194 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	IFNAR2	P48551	515 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PSMC6	P62333	389 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	WDR59	Q6PJI9	974 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SERPING1	P05155	500 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	AOC3	Q16853	763 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	AMFR	Q9UKV5	643 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A087X0T9	212 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM228B	P0C875	321 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	MYBL2	P10244	700 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	INPP5B	P32019	993 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		13.94	□□□□□ -0.18

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