RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MSH4O15457 936 aa13.03□□□□□ -0.32
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EHD2Q9NZN4 543 aa13.02□□□□□ -0.32
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SREBF1P36956 1147 aa13.02□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNA2P51530 1060 aa13.02□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP14P54578 494 aa13.02□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HAUS3Q68CZ6 603 aa13.02□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HDXQ7Z353 690 aa13.02□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C7orf43Q8WVR3 580 aa13.02□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RUSC1Q9BVN2 902 aa13.02□□□□□ -0.33
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHACTR2O75167 634 aa13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CASP8Q14790 479 aa13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIGA2Q7L4E1 593 aa13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAAF5Q86Y56 855 aa13.01□□□□□ -0.33
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAPGEF1Q13905 1077 aa13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q4G0T1 1027 aa13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STYK1Q6J9G0 422 aa13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CREG2Q8IUH2 290 aa13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FLAD1Q8NFF5 587 aa13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM58Q8NG06 486 aa13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FRMD3A2A2Y4 597 aa13□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TACC1O75410 805 aa13□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYBL2P10244 700 aa13□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM133AQ8N9E0 248 aa13□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HDAC7Q8WUI4 952 aa13□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEP63Q96MT8 703 aa13□□□□□ -0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSGA10Q9BZW7 698 aa13□□□□□ -0.33
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