RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600026.5

LTBP4-227, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-227	ENST00000600026	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	24.78	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	ZEB2	O60315	1214 aa		24.78	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	MARCH6	O60337	910 aa		24.78	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	ACLY	P53396	1101 aa		24.78	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		24.78	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		24.78	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	24.78	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	SPATA32	Q96LK8	384 aa		24.78	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	GPR20	Q99678	358 aa		24.78	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		24.78	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		24.78	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	WDR81	Q562E7	1941 aa		24.78	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	LAD1	O00515	517 aa		24.77	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	MYL3	P08590	195 aa		24.77	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	COL6A1	P12109	1028 aa		24.77	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	PTGDR	Q13258	359 aa		24.77	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC39A14	Q15043	492 aa		24.77	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		24.77	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		24.77	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		24.77	■■□□□ 1.56
LTBP4-227	ENST00000600026	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026		A0A1W2PQY0	241 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	TBX3	O15119	743 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	CALCRL	Q16602	461 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	DGKD	Q16760	1214 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	HAS1	Q92839	578 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	FERMT2	Q96AC1	680 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	RIT2	Q99578	217 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		24.76	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	ALPK3	Q96L96	1907 aa		24.75	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	SPTLC2	O15270	562 aa		24.75	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	GAS7	O60861	476 aa		24.75	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	PSMD10	O75832	226 aa		24.75	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	CCNE2	O96020	404 aa		24.75	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	24.75	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	24.75	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	PTPA	Q15257	358 aa		24.75	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		24.75	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	24.75	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		24.75	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	ELP1	O95163	1332 aa		24.75	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	KPNA6	O60684	536 aa		24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	OR52Z1	P0C646	297 aa		24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	ACTR2	P61160	394 aa		24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	KRT76	Q01546	638 aa		24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM20A	Q96MK3	541 aa		24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	24.74	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		24.73	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	PPP6R2	O75170	966 aa		24.73	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	LGALS2	P05162	132 aa		24.73	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF286B	P0CG31	522 aa		24.73	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	24.73	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	PRPH	P41219	470 aa		24.73	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	24.73	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	24.73	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	MTMR9	Q96QG7	549 aa		24.73	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		24.73	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		24.73	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	PPFIA4	O75335	1185 aa		24.72	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	CABYR	O75952	493 aa		24.72	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	VAV3	Q9UKW4	847 aa		24.72	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	24.71	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	CHMP2A	O43633	222 aa		24.71	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	24.71	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		24.71	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	24.71	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		24.71	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		24.71	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	TRIM50	Q86XT4	487 aa		24.71	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	KAT2B	Q92831	832 aa		24.71	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		24.71	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		24.71	■■□□□ 1.55
LTBP4-227	ENST00000600026	ATG7	O95352	703 aa		24.7	■■□□□ 1.54
LTBP4-227	ENST00000600026	F2	P00734	622 aa		24.7	■■□□□ 1.54
LTBP4-227	ENST00000600026	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		24.7	■■□□□ 1.54
LTBP4-227	ENST00000600026	TXK	P42681	527 aa		24.7	■■□□□ 1.54
LTBP4-227	ENST00000600026	ME1	P48163	572 aa		24.7	■■□□□ 1.54
LTBP4-227	ENST00000600026	PSMC6	P62333	389 aa		24.7	■■□□□ 1.54
LTBP4-227	ENST00000600026	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	24.7	■■□□□ 1.54
LTBP4-227	ENST00000600026	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	24.7	■■□□□ 1.54
LTBP4-227	ENST00000600026	EMSY	Q7Z589	1322 aa		24.69	■■□□□ 1.54
LTBP4-227	ENST00000600026	WDR64	B1ANS9	1081 aa		24.69	■■□□□ 1.54
LTBP4-227	ENST00000600026	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	24.69	■■□□□ 1.54
LTBP4-227	ENST00000600026	PPP2R5C	Q13362	524 aa		24.69	■■□□□ 1.54

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