RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 FZD1Q9UP38 647 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 TNNQ9UQP3 1299 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 FAM205AQ6ZU69 1335 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 E9PSI1 815 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CCER2I3L3R5 266 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 TSPAN15O95858 294 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 FGFR2P21802 821 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ECE1P42892 770 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 FGD1P98174 961 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 GRM1Q13255 1194 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
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HERC3-212ENST00000597259 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 JAG2Q9Y219 1238 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 PTPRCP08575 1304 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.72□□□□□ -1.33
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HERC3-212ENST00000597259 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 EOMESO95936 686 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 GYG1P46976 350 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 NOGQ13253 232 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.71□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.71□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 RING1Q06587 406 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 CFAP100Q494V2 611 aa6.69□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.69□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 F8W031 263 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 C1QTNF9P0C862 333 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 TM4SF4P48230 202 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 CDK8P49336 464 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.68□□□□□ -1.34
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