RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 TRIM50Q86XT4 487 aa18.33■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 TIFAQ96CG3 184 aa18.33■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 RNPEPQ9H4A4 650 aa18.33■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa18.33■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 ERAP1Q9NZ08 941 aa18.33■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.33■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa18.33■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa18.33■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 NFASCO94856 1347 aa18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 GRXCR1A8MXD5 290 aa18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 MEIS1O00470 390 aa18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 ARP10275 920 aa18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 THPOP40225 353 aa18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 RBL2Q08999 1139 aa18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 NIPA1Q7RTP0 329 aa18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 PLA2G4DQ86XP0 818 aa18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 CYP2W1Q8TAV3 490 aa18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 CTAGE1Q96RT6 745 aa18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 PBX4Q9BYU1 374 aa18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 SETD4Q9NVD3 440 aa18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 NRCAMQ92823 1304 aa18.31■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa18.31■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 TREHO43280 583 aa18.31■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNJ6P48051 423 aa18.31■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF618Q5T7W0 954 aa18.31■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 SERINC5Q86VE9 423 aa18.31■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 EMSYQ7Z589 1322 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 RSPH10B2B2RC85 870 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 BAIAP3O94812 1187 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 CYP3A4P08684 503 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 RSPH10BP0C881 870 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 XBP1P17861 261 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 MARK3P27448 753 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 GUCD1Q96NT3 240 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF576Q9H609 170 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC28A3Q9HAS3 691 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 TELO2Q9Y4R8 837 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 KIF28PB7ZC32 967 aa18.29■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 PBX2P40425 430 aa18.29■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 ACTR2P61160 394 aa18.29■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 PPFIA1Q13136 1202 aa18.29■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 HIC1Q14526 733 aa18.29■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 CNKSR3Q6P9H4 555 aa18.29■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.29■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC9A7Q96T83 725 aa18.29■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF577Q9BSK1 485 aa18.29■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM86B1E9PN63 330 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 BACH1O14867 736 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 EFCAB14O75071 495 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 CAND2O75155 1236 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM86B2P0C5J1 330 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 HOXC8P31273 242 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 STAT5BP51692 787 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 AK2P54819 239 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 SCRN1Q12765 414 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 IKBKEQ14164 716 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 RSPH3Q86UC2 560 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 WNT8BQ93098 351 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 VWCEQ96DN2 955 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 TBC1D22BQ9NU19 505 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDHA4Q9UN74 947 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 TRPC6Q9Y210 931 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 PFKFB2O60825 505 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 NBNO60934 754 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 LGR5O75473 907 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 CXCL10P02778 98 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 NEK4P51957 841 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 GRIK4Q16099 956 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 PRR16Q569H4 304 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM160B1Q5W0V3 765 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 GALNT17Q6IS24 598 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 BLIDQ8IZY5 108 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-215ENST00000589825 TET1Q8NFU7 2136 aa18.26■□□□□ 0.51
EFTUD2-215ENST00000589825 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa18.26■□□□□ 0.51
EFTUD2-215ENST00000589825 CTSHP09668 335 aa18.26■□□□□ 0.51
EFTUD2-215ENST00000589825 FOSL2P15408 326 aa18.26■□□□□ 0.51
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC26A2P50443 739 aa18.26■□□□□ 0.51
EFTUD2-215ENST00000589825 USP11P51784 963 aa18.26■□□□□ 0.51
EFTUD2-215ENST00000589825 RABGGTBP53611 331 aa18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms