RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578446.1

USP22-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 3

Gene USP22, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-208	ENST00000578446		Q9Y3F1	56 aa		12.01	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		12.01	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	MCM3AP	O60318	1980 aa		12.01	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	BACH1	O14867	736 aa		12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	PGK1	P00558	417 aa		12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	IL17A	Q16552	155 aa		12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	RDM1	Q8NG50	284 aa		12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	ERMN	Q8TAM6	284 aa		12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	DEFB118	Q96PH6	123 aa		12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	GPR20	Q99678	358 aa		12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	DISC1	Q9NRI5	854 aa		12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		12	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	CUTA	O60888	179 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	PSAP	P07602	524 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	MMP3	P08254	477 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	TXLNA	P40222	546 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	GJA9	P57773	515 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	GRIN1	Q05586	938 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	DGKD	Q16760	1214 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	RNF180	Q86T96	592 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	AK8	Q96MA6	479 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	CSRNP2	Q9H175	543 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	AZI2	Q9H6S1	392 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	MYADML2	A6NDP7	307 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446		A6NJR5	290 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	PP2D1	A8MPX8	630 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	EML1	O00423	815 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	ZEB2	O60315	1214 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	ADAMTS4	O75173	837 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	ZNF286B	P0CG31	522 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	UBA7	P41226	1012 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	BEX3	Q00994	111 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	PDIA5	Q14554	519 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	EPHA7	Q15375	998 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	KRT79	Q5XKE5	535 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	LHX8	Q68G74	356 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	GLG1	Q92896	1179 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	STK24	Q9Y6E0	443 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	POTEF	A5A3E0	1075 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	KBTBD13	C9JR72	458 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	PPFIA4	O75335	1185 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	GJB1	P08034	283 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	MYL3	P08590	195 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	CDC25A	P30304	524 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	CYP4A11	Q02928	519 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	SPECC1	Q5M775	1068 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	TRIM50	Q86XT4	487 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	BANK1	Q8NDB2	785 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	LXN	Q9BS40	222 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	ZNF302	Q9NR11	478 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
USP22-208	ENST00000578446	EMSY	Q7Z589	1322 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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