RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CTDNEP1-207ENST00000572043 GLG1Q92896 1179 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDNEP1-207ENST00000572043 SDF4Q9BRK5 362 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDNEP1-207ENST00000572043 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDNEP1-207ENST00000572043 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.28■□□□□ 0.84
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CTDNEP1-207ENST00000572043 SEC24BO95487 1268 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.27■□□□□ 0.84
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CTDNEP1-207ENST00000572043 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDNEP1-207ENST00000572043 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.27■□□□□ 0.84
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CTDNEP1-207ENST00000572043 RBL2Q08999 1139 aa20.26■□□□□ 0.83
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CTDNEP1-207ENST00000572043 GNAT1P11488 350 aa20.24■□□□□ 0.83
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CTDNEP1-207ENST00000572043 ACTR2P61160 394 aa20.24■□□□□ 0.83
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CTDNEP1-207ENST00000572043 PRR16Q569H4 304 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-207ENST00000572043 MCTP2Q6DN12 878 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-207ENST00000572043 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-207ENST00000572043 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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CTDNEP1-207ENST00000572043 TRPC6Q9Y210 931 aa20.22■□□□□ 0.83
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CTDNEP1-207ENST00000572043 ADAM17P78536 824 aa20.2■□□□□ 0.82
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CTDNEP1-207ENST00000572043 SCN5AQ14524 2016 aa20.19■□□□□ 0.82
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CTDNEP1-207ENST00000572043 INSRRP14616 1297 aa20.19■□□□□ 0.82
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