RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	MARK3	P27448	753 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	EPOP	A6NHQ4	379 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	AMH	P03971	560 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	CPA1	P15085	419 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	SEPT8	Q92599	483 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	JADE2	Q9NQC1	790 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPRS	Q13332	1948 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	GJB5	O95377	273 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	HOXC8	P31273	242 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	RAD9A	Q99638	391 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	NRCAM	Q92823	1304 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	SMCO2	A6NFE2	343 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	CAND2	O75155	1236 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	28.98	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	PPFIA1	Q13136	1202 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	28.98	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	SPRED2	Q7Z698	418 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	MAFG	O15525	162 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF76	P36508	570 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	APOBR	Q0VD83	1088 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966		Q6ZUG5	572 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	SDF4	Q9BRK5	362 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	ANO3	Q9BYT9	981 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	STXBP3	O00186	592 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	CDC27	P30260	824 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	IGBP1	P78318	339 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	KRT40	Q6A162	431 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	ASB2	Q96Q27	587 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	AZI2	Q9H6S1	392 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM260	Q9NX78	707 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	BARHL2	Q9NY43	387 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	VCAN	P13611	3396 aa		28.95	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	FUT2	Q10981	343 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	GRB10	Q13322	594 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	GRIK4	Q16099	956 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	RSPH3	Q86UC2	560 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	BRF1	Q92994	677 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	KAT6A	Q92794	2004 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	UPP2	O95045	317 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	INSL6	Q9Y581	213 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	TRPC6	Q9Y210	931 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	HSPA4	P34932	840 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	RCAN1	P53805	252 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	AP3B2	Q13367	1082 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	CEP55	Q53EZ4	464 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	LINC01553	A4QN01	128 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	REC8	O95072	547 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	AR	P10275	920 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	ADAM17	P78536	824 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	YME1L1	Q96TA2	773 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	SCG2	P13521	617 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	APBB2	Q92870	758 aa		28.9	■■■□□ 2.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms