RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT79Q5XKE5 535 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 PACS2Q86VP3 889 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 NDST4Q9H3R1 872 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 VEZTQ9HBM0 779 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC63Q05C16 580 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAN2A1Q16706 1144 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBE2SQ16763 222 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 CACNB3P54284 484 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 EHHADHQ08426 723 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSMD2Q13200 908 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 VAV2P52735 878 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNK18Q7Z418 384 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDX12PQ92771 950 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 CUL5Q93034 780 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 MMS19Q96T76 1030 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 IDEP14735 1019 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 GUCY2CP25092 1073 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 SHMT1P34896 483 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYP27A1Q02318 531 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 SULF1Q8IWU6 871 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC42Q96M95 316 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 SRGAP2O75044 1071 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF5AQ12840 1032 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 IQCEQ6IPM2 695 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 GBP6Q6ZN66 633 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRIQ9BWK5 157 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP40Q9NVE5 1235 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 PASKQ96RG2 1323 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF263O14978 683 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHACTR2O75167 634 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPA17Q15506 151 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 ECM1Q16610 540 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 HAS1Q92839 578 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-205ENST00000564630 A6NNZ2 444 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGPSO00116 658 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 EPHB6O15197 1021 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLSTN1O94985 981 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSG101Q99816 390 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB5O15062 677 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 SEPT2Q15019 361 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC96Q2M329 555 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTMR8Q96EF0 704 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC16A2P36021 539 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 SH3GL2Q99962 352 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP17L10C9JJH3 530 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRLRP16471 622 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPFIA1Q13136 1202 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms