RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563854.1

NME3-205, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 5

Gene NME3, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-205ENST00000563854 TLL1O43897 1013 aa20.22■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 CXCL10P02778 98 aa20.22■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 GNAT1P11488 350 aa20.22■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 KCNB2Q92953 911 aa20.22■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 BARHL2Q9NY43 387 aa20.22■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 LGR5O75473 907 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 RPS6KB1P23443 525 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 RCAN1P53805 252 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 IKBKEQ14164 716 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 GLG1Q92896 1179 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 EMSYQ7Z589 1322 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-205ENST00000563854 PTPRSQ13332 1948 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 RFXAPO00287 272 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 PPFIA3O75145 1194 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 ARHGEF15O94989 841 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 PSMA5P28066 241 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 HOXC8P31273 242 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 ZNF76P36508 570 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 SCG2P13521 617 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 PPFIA1Q13136 1202 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 AP3B2Q13367 1082 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 PHKBQ93100 1093 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 SDF4Q9BRK5 362 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 LCHNA4D1U4 455 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 MAFGO15525 162 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 ARP10275 920 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 IGBP1P78318 339 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 TAP1Q03518 808 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 NRCAMQ92823 1304 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 EFCAB14O75071 495 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 SREBF1P36956 1147 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 GRIK4Q16099 956 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 CEP55Q53EZ4 464 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 SPRED2Q7Z698 418 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 AZI2Q9H6S1 392 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 EPOPA6NHQ4 379 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 CAND2O75155 1236 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 SEPT8Q92599 483 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 UIMC1Q96RL1 719 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 TRPC6Q9Y210 931 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 NID2Q14112 1375 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 MYO9BQ13459 2157 aa20.15■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 GJB5O95377 273 aa20.15■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 AMHP03971 560 aa20.15■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 ACTR2P61160 394 aa20.15■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 ADAM17P78536 824 aa20.15■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.15■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.15■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 C6orf50Q9HD87 102 aa20.15■□□□□ 0.82
NME3-205ENST00000563854 NFASCO94856 1347 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-205ENST00000563854 ADAMTS3O15072 1205 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-205ENST00000563854 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NME3-205ENST00000563854 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NME3-205ENST00000563854 PKN1Q16512 942 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-205ENST00000563854 RUFY3Q7L099 469 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-205ENST00000563854 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-205ENST00000563854 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NME3-205ENST00000563854 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-205ENST00000563854 PCYT2Q99447 389 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-205ENST00000563854 RAD9AQ99638 391 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms