RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560576.1

TMOD2-204, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD2, Length 2,348 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-204ENST00000560576 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 TTC3P53804 2025 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 C5orf67F2Z3F1 127 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 ADAM17P78536 824 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SEMA3FQ13275 785 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 RSPH3Q86UC2 560 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 KCNH6Q9H252 994 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 NRCAMQ92823 1304 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 CYTH3O43739 400 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 IGHDP01880 384 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 BMPR1AP36894 532 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SP4Q02446 784 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 ZP2Q05996 745 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 TRIM50Q86XT4 487 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 NCOA7Q8NI08 942 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 POTEB3A0JP26 581 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 GHRP10912 638 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 POTEBQ6S5H4 581 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 CDHR1Q96JP9 859 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 CHRNA1P02708 482 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 MGAT3Q09327 533 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 TROAPQ12815 778 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 PPFIA1Q13136 1202 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 GPRASP2Q96D09 838 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 MAP3K14Q99558 947 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 E7EWF7 191 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 PIK3CDO00329 1044 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 ENPP3O14638 875 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 GRM6O15303 877 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 MBTPS2O43462 519 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 CYP21A2P08686 494 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SMARCA1P28370 1054 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 KIF5BP33176 963 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 HYAL1Q12794 435 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 LPIN1Q14693 890 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 GRIK4Q16099 956 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 PLVAPQ9BX97 442 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 IL25Q9H293 177 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SENP2Q9HC62 589 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 DDAH1O94760 285 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 MMP1P03956 469 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 LTBRP36941 435 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 P2RX5Q93086 422 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 CD207Q9UJ71 328 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 CDY2AQ9Y6F7 541 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 KCNA2P16389 499 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 IRS1P35568 1242 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 GNAQP50148 359 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 PTH1RQ03431 593 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 CLUL1Q15846 466 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms