RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 CLTBP09497 229 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 PSEN2P49810 448 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 ACTR2P61160 394 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT76Q01546 638 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC5A5Q92911 643 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 RIT2Q99578 217 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 HAS3O00219 553 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 GAS7O60861 476 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 PDCP20941 246 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 SESTD1Q86VW0 696 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM50Q86XT4 487 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 UIMC1Q96RL1 719 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 CCNE2O96020 404 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 C7orf31Q8N865 590 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 AZI2Q9H6S1 392 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 EVPLQ92817 2033 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 H0YGN5 161 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 TBX3O15119 743 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 B4GALT4O60513 344 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 FAAP100Q0VG06 881 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 MCTP1Q6DN14 999 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 GLG1Q92896 1179 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM20AQ96MK3 541 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 ARID2Q68CP9 1835 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF28PB7ZC32 967 aa21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 LGR5O75473 907 aa21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 PSMD10O75832 226 aa21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 CD4P01730 458 aa21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 SYN1P17600 705 aa21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 TRAPPC10P48553 1259 aa21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.33■■□□□ 1.01
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RABGGTA-208ENST00000558954 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 SCN5AQ14524 2016 aa21.33■■□□□ 1
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RABGGTA-208ENST00000558954 SFNP31947 248 aa21.32■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 JAK3P52333 1124 aa21.32■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.32■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.32■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.32■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.32■■□□□ 1
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RABGGTA-208ENST00000558954 TBX21Q9UL17 535 aa21.32■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 SAMM50Q9Y512 469 aa21.32■■□□□ 1
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RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA0355O15063 1070 aa21.31■■□□□ 1
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RABGGTA-208ENST00000558954 PSAPP07602 524 aa21.31■■□□□ 1
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RABGGTA-208ENST00000558954 SLC26A2P50443 739 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 GJA10Q969M2 543 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 NOD1Q9Y239 953 aa21.31■■□□□ 1
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RABGGTA-208ENST00000558954 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.3■■□□□ 1
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RABGGTA-208ENST00000558954 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 MARK3P27448 753 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 STAT5BP51692 787 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 CALCRLQ16602 461 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 PTGISQ16647 500 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 TTC38Q5R3I4 469 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-208ENST00000558954 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.3■■□□□ 1
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