RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 KLRC3Q07444 240 aa24.95■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 C2orf54Q08AI8 447 aa24.95■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.95■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.95■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.95■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 CATSPER3Q86XQ3 398 aa24.95■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 COG1Q8WTW3 980 aa24.95■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 LENG9Q96B70 501 aa24.95■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 AMNQ9BXJ7 453 aa24.95■■□□□ 1.58
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RCCD1-208ENST00000557266 EXOC4Q96A65 974 aa24.94■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 VPS18Q9P253 973 aa24.94■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.94■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.94■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 ZMYND10O75800 440 aa24.94■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 NDUFB10O96000 172 aa24.94■■□□□ 1.58
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RCCD1-208ENST00000557266 APBA1Q02410 837 aa24.94■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.589e-8■□□□□ 11
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RCCD1-208ENST00000557266 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.94■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.94■■□□□ 1.58
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RCCD1-208ENST00000557266 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 IQCEQ6IPM2 695 aa24.93■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.93■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.93■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 FAM86B1E9PN63 330 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 CASP5P51878 434 aa24.92■■□□□ 1.58
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RCCD1-208ENST00000557266 USH1GQ495M9 461 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 MAP9Q49MG5 647 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 TXLNBQ8N3L3 684 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 GMCL1Q96IK5 515 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 OSBPL9Q96SU4 736 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 PSD3Q9NYI0 1048 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 FAN1Q9Y2M0 1017 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 TBX3O15119 743 aa24.92■■□□□ 1.58
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RCCD1-208ENST00000557266 ADAM9Q13443 819 aa24.92■■□□□ 1.58
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RCCD1-208ENST00000557266 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 TAF3Q5VWG9 929 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.92■■□□□ 1.58
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RCCD1-208ENST00000557266 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 SCN9AQ15858 1988 aa24.92■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 MEIS1O00470 390 aa24.91■■□□□ 1.58
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RCCD1-208ENST00000557266 CCDC102AQ96A19 550 aa24.91■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 RPA1P27694 616 aa24.91■■□□□ 1.58
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RCCD1-208ENST00000557266 MMGT1Q8N4V1 131 aa24.91■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 ERMNQ8TAM6 284 aa24.91■■□□□ 1.58
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RCCD1-208ENST00000557266 HYOU1Q9Y4L1 999 aa24.91■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 OPLAHO14841 1288 aa24.9■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 MMP14P50281 582 aa24.9■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 ITIH3Q06033 890 aa24.9■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 MCTP2Q6DN12 878 aa24.9■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 FAM71BQ8TC56 605 aa24.9■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 NCK2O43639 380 aa24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 NOX5Q96PH1 765 aa24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 PSMB7Q99436 277 aa24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 REEP2Q9BRK0 252 aa24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 TLR10Q9BXR5 811 aa24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 ACBD3Q9H3P7 528 aa24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 DNM3Q9UQ16 869 aa24.89■■□□□ 1.58
RCCD1-208ENST00000557266 NR2F2P24468 414 aa24.89■■□□□ 1.57
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