RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556956.1

SLIRP-208, Transcript of SRA stem-loop interacting RNA binding protein, human

TSL 2

Gene SLIRP, Length 450 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLIRP-208	ENST00000556956	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956	MYOM2	P54296	1465 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956	PIK3R4	Q99570	1358 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
SLIRP-208	ENST00000556956		A0A1W2PQJ5	194 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CCDC66	A2RUB6	948 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	FFAR3	O14843	346 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PLCH2	O75038	1416 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	FKTN	O75072	461 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	HMMR	O75330	724 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TBC1D8	O95759	1140 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ITGA4	P13612	1032 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SDS	P20132	328 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	MX1	P20591	662 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NEK4	P51957	841 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	INHBE	P58166	350 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PAK2	Q13177	524 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NFE2L2	Q16236	605 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CSRP2	Q16527	193 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NLRX1	Q86UT6	975 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	JAML	Q86YT9	394 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ANKRD7	Q92527	254 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GPRASP2	Q96D09	838 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TMX3	Q96JJ7	454 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	MADD	Q8WXG6	1647 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ABCC4	O15439	1325 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	IQGAP1	P46940	1657 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TRPM2	O94759	1503 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TMEM82	A0PJX8	343 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SMTNL1	A8MU46	457 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	MEIS1	O00470	390 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PPM1B	O75688	479 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZNF205	O95201	554 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ACR	P10323	421 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NAT2	P11245	290 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CD247	P20963	164 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SOX9	P48436	509 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	UBE2H	P62256	183 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CYP4F8	P98187	520 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	PKP1	Q13835	747 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ATP2B3	Q16720	1220 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ADGRF1	Q5T601	910 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	IL17RA	Q96F46	866 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GBP3	Q9H0R5	595 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GP6	Q9HCN6	339 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLIRP-208	ENST00000556956	GINM1	Q9NU53	330 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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