RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555436.1

CBLN3-202, Transcript of cerebellin 3 precursor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CBLN3, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3-202ENST00000555436 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.23■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 TMEM260Q9NX78 707 aa22.23■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.23■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 A0A0C4DFX4 3053 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 CAND2O75155 1236 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 RSPH10BP0C881 870 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 KCNJ6P48051 423 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 ADAM17P78536 824 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 NTRK3Q16288 839 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
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CBLN3-202ENST00000555436 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 EMSYQ7Z589 1322 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 NRCAMQ92823 1304 aa22.22■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 TET1Q8NFU7 2136 aa22.21■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.21■■□□□ 1.15
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CBLN3-202ENST00000555436 PHKBQ93100 1093 aa22.21■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.21■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.21■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.21■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 NFASCO94856 1347 aa22.21■■□□□ 1.15
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CBLN3-202ENST00000555436 MEIS1O00470 390 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 EFCAB14O75071 495 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 LGR5O75473 907 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 CA3P07451 260 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 ARP10275 920 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 IFNAR1P17181 557 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 ARHGAP4P98171 946 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 TCTN1Q2MV58 587 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 MCTP2Q6DN12 878 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 GLG1Q92896 1179 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 SDF4Q9BRK5 362 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 C6orf50Q9HD87 102 aa22.2■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 EYSQ5T1H1 3165 aa22.19■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 KIF28PB7ZC32 967 aa22.19■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 IKBKEQ14164 716 aa22.19■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.19■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.19■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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CBLN3-202ENST00000555436 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.18■■□□□ 1.14
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CBLN3-202ENST00000555436 MARK3P27448 753 aa22.18■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 GNA11P29992 359 aa22.18■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF76P36508 570 aa22.18■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 PPFIA1Q13136 1202 aa22.18■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 ADGRE1Q14246 886 aa22.18■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.18■■□□□ 1.14
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CBLN3-202ENST00000555436 FAM86B1E9PN63 330 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 ADAMTS3O15072 1205 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 PPFIA3O75145 1194 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 CTSHP09668 335 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 ACTR2P61160 394 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 DEFB103AP81534 67 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 PCYT2Q99447 389 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 AZI2Q9H6S1 392 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.17■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 TLL1O43897 1013 aa22.16■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 GRIK4Q16099 956 aa22.16■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.16■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.16■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 RPAINQ86UA6 219 aa22.16■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.16■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 BICD2Q8TD16 824 aa22.16■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.15■■□□□ 1.14
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CBLN3-202ENST00000555436 DLL1O00548 723 aa22.15■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 TAP1Q03518 808 aa22.15■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 FAM26DQ5JW98 314 aa22.15■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.15■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.15■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 USP38Q8NB14 1042 aa22.15■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.15■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.15■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.15■■□□□ 1.14
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