RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 CNGA1P29973 690 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 INF2Q27J81 1249 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 NSMFQ6X4W1 530 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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USP15-218ENST00000552346 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 PRR31Q5SQ13 230 aa7.19□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.19□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.19□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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USP15-218ENST00000552346 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 SRRDQ9UH36 339 aa7.19□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.19□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 ALG1L2C9J202 215 aa7.18□□□□□ -1.26
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USP15-218ENST00000552346 FSHBP01225 129 aa7.18□□□□□ -1.26
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USP15-218ENST00000552346 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.18□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.18□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.18□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.18□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 SDSP20132 328 aa7.17□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 GRIA2P42262 883 aa7.17□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 MROH9Q5TGP6 573 aa7.17□□□□□ -1.26
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USP15-218ENST00000552346 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.17□□□□□ -1.26
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USP15-218ENST00000552346 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.17□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 FRS2Q8WU20 508 aa7.17□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 CEP89Q96ST8 783 aa7.17□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.17□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.17□□□□□ -1.26
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USP15-218ENST00000552346 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 NPTXRO95502 500 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 NKX3-2P78367 333 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 SURF1Q15526 300 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 CEP68Q76N32 757 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 CCDC140Q96MF4 163 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.16□□□□□ -1.26
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USP15-218ENST00000552346 EVA1CP58658 441 aa7.15□□□□□ -1.26
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USP15-218ENST00000552346 CR1LQ2VPA4 569 aa7.15□□□□□ -1.26
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USP15-218ENST00000552346 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.15□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 AHI1Q8N157 1196 aa7.15□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.15□□□□□ -1.26
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USP15-218ENST00000552346 DLX3O60479 287 aa7.14□□□□□ -1.27
USP15-218ENST00000552346 B4GALT3O60512 393 aa7.14□□□□□ -1.27
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USP15-218ENST00000552346 HOXC12P31275 282 aa7.14□□□□□ -1.27
USP15-218ENST00000552346 CYP4F3Q08477 520 aa7.14□□□□□ -1.27
USP15-218ENST00000552346 ODR4Q5SWX8 454 aa7.14□□□□□ -1.27
USP15-218ENST00000552346 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.14□□□□□ -1.27
USP15-218ENST00000552346 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
USP15-218ENST00000552346 PLEKHH3Q7Z736 793 aa7.14□□□□□ -1.27
USP15-218ENST00000552346 Q8N1Y9 231 aa7.14□□□□□ -1.27
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