RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550244.1

ZDHHC17-210, Transcript of zinc finger DHHC-type containing 17, humanhuman

TSL 3

Gene ZDHHC17, Length 1,188 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC17-210ENST00000550244 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.54□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 MFSD3Q96ES6 412 aa6.54□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.54□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.54□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 TSPY4P0CV99 314 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 TSPY10P0CW01 314 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 GTF2A2P52657 109 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 GYS2P54840 703 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 CORO7P57737 925 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 BRAPQ7Z569 592 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 FAM129CQ86XR2 697 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 NIM1KQ8IY84 436 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 PREX2Q70Z35 1606 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.53□□□□□ -1.36
ZDHHC17-210ENST00000550244 CEP162Q5TB80 1403 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 ANKRD62A6NC57 917 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 HRKO00198 91 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 ARNTLO00327 626 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 TACR2P21452 398 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 RTP1P59025 263 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 SLC14A2Q15849 920 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 INF2Q27J81 1249 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 CPZQ66K79 652 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 MBLAC2Q68D91 279 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 JMJD8Q96S16 334 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 EBF1Q9UH73 591 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.52□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 C7orf72A4D263 438 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 NRDCO43847 1150 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 LCP1P13796 627 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 KIZQ2M2Z5 673 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 TM4SF20Q53R12 229 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 ADGRF1Q5T601 910 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 LBX2Q6XYB7 198 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 ALG1Q9BT22 464 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.51□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.5□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 GUCY1A3Q02108 690 aa6.5□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.5□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 FBXO41Q8TF61 875 aa6.5□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.5□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.5□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 A0A1W2PQ27 194 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 A0A1W2PQ64 194 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 A0A1W2PQC6 194 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 A0A1W2PQD8 194 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 B4E1Z4 1266 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 ARVCFO00192 962 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 MSCO60682 206 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 DNAJC6O75061 913 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 CRTAMO95727 393 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 ASLP04424 464 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 ACVRL1P37023 503 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 GALK1P51570 392 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 LSAMPQ13449 338 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 FERMT3Q86UX7 667 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 Q8N1Y9 231 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 SCLYQ96I15 445 aa6.49□□□□□ -1.37
ZDHHC17-210ENST00000550244 PWWP2AQ96N64 755 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms