RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 BABAM1Q9NWV8 329 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ABCC4O15439 1325 aa6.78□□□□□ -1.32
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TRDN-205ENST00000546248 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 PPP2R5EQ16537 467 aa6.78□□□□□ -1.32
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TRDN-205ENST00000546248 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.78□□□□□ -1.32
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TRDN-205ENST00000546248 TM9SF2Q99805 663 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 SLIT3O75094 1523 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 ZNF205O95201 554 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 ACRP10323 421 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 CCNFP41002 786 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 NFIXQ14938 502 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 G2E3Q7L622 706 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 SMC5Q8IY18 1101 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 MZB1Q8WU39 189 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 SLC6A18Q96N87 628 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 SLC9A7Q96T83 725 aa6.77□□□□□ -1.33
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TRDN-205ENST00000546248 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 USP54Q70EL1 1684 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 DCCP43146 1447 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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TRDN-205ENST00000546248 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 IGSF3O75054 1194 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 PRKCAP17252 672 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 GUCY2CP25092 1073 aa6.76□□□□□ -1.33
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TRDN-205ENST00000546248 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 BRINP3Q76B58 766 aa6.76□□□□□ -1.33
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TRDN-205ENST00000546248 MAP3K5Q99683 1374 aa6.76□□□□□ -1.33
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TRDN-205ENST00000546248 RGS12O14924 1447 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 NCAPD2Q15021 1401 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.76□□□□□ -1.33
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TRDN-205ENST00000546248 ABLIM1O14639 778 aa6.75□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 KCNQ3O43525 872 aa6.75□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 MPOP05164 745 aa6.75□□□□□ -1.33
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TRDN-205ENST00000546248 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.75□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.75□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 TMC6Q7Z403 805 aa6.75□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 FAM129CQ86XR2 697 aa6.75□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.75□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.75□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 FBXO41Q8TF61 875 aa6.75□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 UBXN4Q92575 508 aa6.75□□□□□ -1.33
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TRDN-205ENST00000546248 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.75□□□□□ -1.33
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TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PQH9 124 aa6.74□□□□□ -1.33
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TRDN-205ENST00000546248 SASH1O94885 1247 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 VAV1P15498 845 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 SYN1P17600 705 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 CYP4F8P98187 520 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 NUCB1Q02818 461 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 RBL2Q08999 1139 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 LAPTM5Q13571 262 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 TNNI3KQ59H18 835 aa6.74□□□□□ -1.33
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