RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 NFASCO94856 1347 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 STXBP3O00186 592 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 OPLAHO14841 1288 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 BACH1O14867 736 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CTAGE5O15320 804 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ADCY6O43306 1168 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ST18O60284 1047 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MARCH6O60337 910 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ARIH2O95376 493 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 F2P00734 622 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CSF2RAP15509 400 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SELPP16109 830 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SREBF1P36956 1147 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 USP11P51784 963 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMC6P62333 389 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP4P98171 946 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 HERVK_113Q902F9 699 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 COPS5Q92905 334 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ANO3Q9BYT9 981 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNH6Q9H252 994 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR33A8MZF0 331 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 LGALS2P05162 132 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PSAPP07602 524 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP3A4P08684 503 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJB2P25686 324 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TMOD1P28289 359 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CDC27P30260 824 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SFNP31947 248 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP2C18P33260 490 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 THPOP40225 353 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 NEK4P51957 841 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CCL23P55773 120 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CDC42EP1Q00587 391 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT76Q01546 638 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 IKBKEQ14164 716 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE2SQ16763 222 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 IER5Q5VY09 327 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF365Q70YC5 407 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 NME8Q8N427 588 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 APBB2Q92870 758 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM167AQ96KS9 214 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC9A7Q96T83 725 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR20Q99678 358 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF576Q9H609 170 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SAMM50Q9Y512 469 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 GBF1Q92538 1859 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 STK36Q9NRP7 1315 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 HAS3O00219 553 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MEIS1O00470 390 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PFKFB2O60825 505 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RGS20O76081 388 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 IQCF3P0C7M6 154 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RSPH10BP0C881 870 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF286BP0CG31 522 aa6.35□□□□□ -1.39
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