RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542019.1

TM7SF3-210, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-210ENST00000542019 NFASCO94856 1347 aa28.29■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 PITPNM1O00562 1244 aa28.29■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 HOXC8P31273 242 aa28.29■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 BLIDQ8IZY5 108 aa28.29■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 PCYT2Q99447 389 aa28.29■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.29■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.29■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 IQCF3P0C7M6 154 aa28.28■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 DAGLBQ8NCG7 672 aa28.28■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 PHF20Q9BVI0 1012 aa28.28■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 JAK2O60674 1132 aa28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 CCNE2O96020 404 aa28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 MARK3P27448 753 aa28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 CIITAP33076 1130 aa28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 ACTR2P61160 394 aa28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 BFSP2Q13515 415 aa28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 PRR16Q569H4 304 aa28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 LENG9Q96B70 501 aa28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 SDF4Q9BRK5 362 aa28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 SETD4Q9NVD3 440 aa28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.26■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 DHX15O43143 795 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 TREHO43280 583 aa28.26■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 PTK7Q13308 1070 aa28.26■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 GPNMBQ14956 572 aa28.26■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 RASIP1Q5U651 963 aa28.26■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 Q7L0L9 218 aa28.26■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 TBCKQ8TEA7 893 aa28.26■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 CKBP12277 381 aa28.25■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 RBL2Q08999 1139 aa28.25■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.25■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 RETREG2Q8NC44 543 aa28.25■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 CAGE1Q8TC20 777 aa28.25■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.25■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 EMSYQ7Z589 1322 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 LGR5O75473 907 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 SERINC5Q86VE9 423 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 OXER1Q8TDS5 423 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 LMBR1Q8WVP7 490 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 HERVK_113Q902F9 699 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 GLG1Q92896 1179 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF577Q9BSK1 485 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 FGBP02675 491 aa28.23■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 ADAM17P78536 824 aa28.23■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 SETQ01105 290 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.23■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.23■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.23■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.23■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 TDP2O95551 362 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 SELPP16109 830 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 GALNT17Q6IS24 598 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 GJA10Q969M2 543 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 ERAP1Q9NZ08 941 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 ATG7O95352 703 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 USP11P51784 963 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 FOSBP53539 338 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 GPR153Q6NV75 609 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 CCDC83Q8IWF9 413 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-210ENST00000542019 NBNO60934 754 aa28.2■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 RFC2P35250 354 aa28.2■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 MBTPS1Q14703 1052 aa28.2■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 INF2Q27J81 1249 aa28.2■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 ABHD15Q6UXT9 468 aa28.2■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 ZBTB10Q96DT7 871 aa28.2■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa28.19■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 MSH4O15457 936 aa28.19■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 PPFIA1Q13136 1202 aa28.19■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 TCTN1Q2MV58 587 aa28.19■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 DEFB123Q8N688 67 aa28.19■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 NRCAMQ92823 1304 aa28.18■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 TET1Q8NFU7 2136 aa28.18■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM205CA6NFA0 338 aa28.18■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 PFKMP08237 780 aa28.18■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 XBP1P17861 261 aa28.18■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 THPOP40225 353 aa28.18■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 STAT5BP51692 787 aa28.18■■■□□ 2.1
TM7SF3-210ENST00000542019 PLCB4Q15147 1175 aa28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms