RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	SP2	Q02086	613 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	ESR2	Q92731	530 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	KAT14	Q9H8E8	782 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRPC6	Q9Y210	931 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	DGKI	O75912	1065 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	GHR	P10912	638 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCND2	P30279	289 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	NT5C2	P49902	561 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	HSD17B4	P51659	736 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARHGAP4	P98171	946 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	CAMK1	Q14012	370 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	NEDD9	Q14511	834 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	PTPN21	Q16825	1174 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	IQCA1	Q86XH1	822 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	PNMA1	Q8ND90	353 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	AMN	Q9BXJ7	453 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	TLE6	Q9H808	572 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	NRCAM	Q92823	1304 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	CHRNA1	P02708	482 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	ITGB1	P05556	798 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRAF1	Q13077	416 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	PGM5	Q15124	567 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	POF1B	Q8WVV4	589 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	DMD	P11532	3685 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRR23A	A6NEV1	266 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	STAG3L1	P0CL83	205 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	DNAJB1	P25685	340 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	NBL1	P41271	181 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	ID4	P47928	161 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	HAND2	P61296	217 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	GHRHR	Q02643	423 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	METTL7B	Q6UX53	244 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	EVI5L	Q96CN4	794 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	NEK1	Q96PY6	1258 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		12.96	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZMYM6	O95789	1325 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	STAM2	O75886	525 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	POLR2M	P0CAP2	368 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	MX1	P20591	662 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADAM17	P78536	824 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	UBE3A	Q05086	875 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	LPIN1	Q14693	890 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	MCTP2	Q6DN12	878 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	SUSD6	Q92537	303 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	GPR20	Q99678	358 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	AAAS	Q9NRG9	546 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPFIA3	O75145	1194 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	GLP2R	O95838	553 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TXNRD1-223	ENST00000531691	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		12.94	□□□□□ -0.34

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