RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 FOXE3Q13461 319 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRK-220ENST00000531466 FHL2Q14192 279 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRK-220ENST00000531466 NRN1LQ496H8 165 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRK-220ENST00000531466 AJUBAQ96IF1 538 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRK-220ENST00000531466 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRK-220ENST00000531466 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRK-220ENST00000531466 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRK-220ENST00000531466 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRK-220ENST00000531466 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRK-220ENST00000531466 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRK-220ENST00000531466 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRK-220ENST00000531466 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRK-220ENST00000531466 CAPNS1P04632 268 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 CHGBP05060 677 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 COL6A2P12110 1019 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 TNNI3KQ59H18 835 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 GPR27Q9NS67 375 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 KCND1Q9NSA2 647 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 FAHP16930 419 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 PPP2R2AP63151 447 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 PFKPQ01813 784 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 MAP4K2Q12851 820 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 USP53Q70EK8 1073 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 IER2Q9BTL4 223 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 TGFB2P61812 414 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 FXNQ16595 210 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 MIIPQ5JXC2 388 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 CD276Q5ZPR3 534 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 KCNJ15Q99712 375 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 CSRNP2Q9H175 543 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 H0Y858 1186 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 IL18BPO95998 194 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 FUKQ8N0W3 1084 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF503Q96F45 646 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 KATNBL1Q9H079 304 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 A0A1W2PQU0 124 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF839A8K0R7 811 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 AGRPO00253 132 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 DLX3O60479 287 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF202O95125 648 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 GJB6O95452 261 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 GNAT1P11488 350 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 COMTP21964 271 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 GRK2P25098 689 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 GRK3P35626 688 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 AGBL4Q5VU57 503 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 EXTL1Q92935 676 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 CAPN10Q9HC96 672 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 ETFBP38117 255 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 DGCR2P98153 550 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 ABHD18Q0P651 414 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-220ENST00000531466 RAC3P60763 192 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 EDAQ92838 391 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 DSEQ9UL01 958 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 PTH1RQ03431 593 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 RNF151Q2KHN1 245 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 LBX2Q6XYB7 198 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 CHFRQ96EP1 664 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 EPN3Q9H201 632 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 ESYT3A0FGR9 886 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 ACOT7O00154 380 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 PLSCR1O15162 318 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 RAD17O75943 681 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 RRADP55042 308 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.213e-6■□□□□ 10.3
PTPRK-220ENST00000531466 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 Q6ZSN1 163 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-220ENST00000531466 KCTD1Q719H9 257 aa7.5□□□□□ -1.21
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