RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLDN1O95832 211 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CXCL10P02778 98 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD99P14209 185 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SELPP16109 830 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PROZP22891 400 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL13P35225 146 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 EPHA5P54756 1037 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 UCNP55089 124 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SATB1Q01826 763 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 POU4F1Q01851 419 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CREB5Q02930 508 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRKCQQ04759 706 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SEMA3FQ13275 785 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAMK2BQ13554 666 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NBR1Q14596 966 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 LBRQ14739 615 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NCAPHQ15003 741 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM47CQ5HY64 1035 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF484Q5JVG2 852 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC4A10Q6U841 1118 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRC8DQ7L1W4 858 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MORC1Q86VD1 984 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 VPS37DQ86XT2 251 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAGSQ8N159 534 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CASP10Q92851 521 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NXPE2Q96DL1 559 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPRC5CQ9NQ84 441 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 AAASQ9NRG9 546 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 DONSONQ9NYP3 566 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 BTBD7Q9P203 1132 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NBASA2RRP1 2371 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 RYR3Q15413 4870 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTPRFP10586 1907 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GUL6 1792 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 DOCK1Q14185 1865 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MROH5Q6ZUA9 1318 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLSPNQ9HAW4 1339 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MGAQ8IWI9 3026 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGAP10A1A4S6 786 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERINC4A6NH21 518 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 C19orf81C9J6K1 198 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC192P0DO97 292 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLURP2P0DP57 97 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL1R1P14778 569 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERCC3P19447 782 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 FECHP22830 423 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CXCL12P48061 93 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADCY7P51828 1080 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRT83P78385 493 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 LTBQ06643 244 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFE2L2Q16236 605 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC44A4Q53GD3 710 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 FHL5Q5TD97 284 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 BROXQ5VW32 411 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MCM10Q7L590 875 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 HDDC3Q8N4P3 179 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC155Q8N6L0 562 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLHL23Q8NBE8 558 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 AFAP1L1Q8TED9 768 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 XAGE3Q8WTP9 111 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 P2RX5Q93086 422 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TOP1MTQ969P6 601 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 L3MBTL2Q969R5 705 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZDHHC15Q96MV8 337 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NELL2Q99435 816 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHRDQ9H2X0 955 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLAAQ9Y263 795 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 COG6Q9Y2V7 657 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 COL1A2P08123 1366 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms