RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 CFPP27918 469 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 ITGA1P56199 1179 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 JAG1P78504 1218 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 SEC23AQ15436 765 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 CD300LDQ6UXZ3 194 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 PWWP2AQ96N64 755 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 YIPF4Q9BSR8 244 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADAMTS20P59510 1910 aa4.84□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 JMJD7P0C870 316 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAHP16930 419 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 NKX3-2P78367 333 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CAP1Q01518 475 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADAM9Q13443 819 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 RTP5Q14D33 572 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF385BQ569K4 471 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 PIK3R6Q5UE93 754 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CPZQ66K79 652 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 LIPIQ6XZB0 460 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 OTOP1Q7RTM1 612 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SAPCD2Q86UD0 394 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 NLGN4XQ8N0W4 816 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 TOX2Q96NM4 488 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ATP23Q9Y6H3 246 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CBX4O00257 560 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRAF5O00463 557 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 FFAR3O14843 346 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 GYS2P54840 703 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CD276Q5ZPR3 534 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CREB3L3Q68CJ9 461 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CIAPIN1Q6FI81 312 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 STK32CQ86UX6 486 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CHST14Q8NCH0 376 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZBTB8AQ96BR9 441 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZSWIM3Q96MP5 696 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ORAI3Q9BRQ5 295 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 A0A087X0B3 334 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC12A8A0AV02 714 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SCDO00767 359 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 KPNA6O60684 536 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 APPP05067 770 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 GJA4P35212 333 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRR31Q5SQ13 230 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 DTX3Q8N9I9 347 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 KYQ8NBH2 561 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 DLG3Q92796 817 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 MTFR1LQ9H019 292 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 RIC8BQ9NVN3 520 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 A0A1B0GTL3 188 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SH3D21A4FU49 640 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRAMEF25A6NGN4 478 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 RASSF10A6NK89 507 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF839A8K0R7 811 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 DVL2O14641 736 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 IRF9Q00978 393 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 VMACQ2NL98 169 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CFAP100Q494V2 611 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 TCERG1LQ5VWI1 586 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 PKN3Q6P5Z2 889 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 THNSL2Q86YJ6 484 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 C2orf69Q8N8R5 385 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms