RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513095.5

SH3BP2-226, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-226ENST00000513095 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 LTBP2Q14767 1821 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 CCNE2O96020 404 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 ITGB8P26012 769 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 ACTR2P61160 394 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 LETM2Q2VYF4 491 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 C7orf31Q8N865 590 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 TBC1D22BQ9NU19 505 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 HDAC6Q9UBN7 1215 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 ATG7O95352 703 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 RAG1P15918 1043 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 GJB2P29033 226 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 CUL4AQ13619 759 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 PPP4R3AQ6IN85 833 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 SLC5A5Q92911 643 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 PCYT2Q99447 389 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 GDF15Q99988 308 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 KIF3AQ9Y496 699 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 EMSYQ7Z589 1322 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 SLC37A4O43826 429 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 LGR5O75473 907 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 CYP2C9P11712 490 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 ABHD15Q6UXT9 468 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 BADQ92934 168 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 GJA10Q969M2 543 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 RIT2Q99578 217 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 PRO3102Q9H379 93 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 SMC3Q9UQE7 1217 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 TIMP1P01033 207 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 HIC1Q14526 733 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 PTGISQ16647 500 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 LRCH2Q5VUJ6 765 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 ETNPPLQ8TBG4 499 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 GLG1Q92896 1179 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 CTAGE1Q96RT6 745 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-226ENST00000513095 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 GAS7O60861 476 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 PSMD10O75832 226 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 MARK3P27448 753 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 HOXC8P31273 242 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 KRT76Q01546 638 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 SNX21Q969T3 373 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 TEKT3Q9BXF9 490 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 HIPK3Q9H422 1215 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 AZI2Q9H6S1 392 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 KCNMB3Q9NPA1 279 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 ERAP1Q9NZ08 941 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 NOD1Q9Y239 953 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 KAT6AQ92794 2004 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 C17orf102A2RUQ5 167 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 KIF28PB7ZC32 967 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 WNT7AO00755 349 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 CYP2C18P33260 490 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 BMP8BP34820 402 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 STAT5BP51692 787 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 MFSD5Q6N075 450 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 NOSTRINQ8IVI9 506 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 UNC45AQ9H3U1 944 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 SETD4Q9NVD3 440 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 BACH1O14867 736 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 SWSAP1Q6NVH7 229 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 B3GNT9Q6UX72 402 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-226ENST00000513095 POTEDQ86YR6 584 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms