RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 EPHA5P54756 1037 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 GPR19Q15760 415 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 PHF19Q5T6S3 580 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 VASNQ6EMK4 673 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 BRAPQ7Z569 592 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 PROSER1Q86XN7 944 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 CLIC6Q96NY7 704 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM209Q96SK2 561 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 PIF1Q9H611 641 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 CROTQ9UKG9 612 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 KCNK3O14649 394 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 AMY2AP04746 511 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 AMY2BP19961 511 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 GJA9P57773 515 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 NFIXQ14938 502 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 MCTP2Q6DN12 878 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 OSTM1Q86WC4 334 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 SCLYQ96I15 445 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 ACOT7O00154 380 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 MAN2B1O00754 1011 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 NOBOXO60393 691 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF28P17035 718 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 JAM2P57087 298 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 SQSTM1Q13501 440 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 CRY1Q16526 586 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 RGL3Q3MIN7 710 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 CD276Q5ZPR3 534 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 CKMP06732 381 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 LCE1DQ5T752 114 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 DTX3Q8N9I9 347 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 WRNIP1Q96S55 665 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 DLL4Q9NR61 685 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 GSTA4O15217 222 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 RAPGEF3O95398 923 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 APPP05067 770 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 FIGNQ5HY92 759 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 RELTQ969Z4 430 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 IL13P35225 146 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 GLRBP48167 497 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 PFKPQ01813 784 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 FERMT3Q86UX7 667 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 TEPSINQ96N21 525 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF839A8K0R7 811 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 PLD2O14939 933 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 KCNQ2O43526 872 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 CYP7B1O75881 506 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 CNR2P34972 360 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 CPZQ66K79 652 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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