RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGAP4P98171 946 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IKBKEQ14164 716 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPM1EQ8WY54 764 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EMSYQ7Z589 1322 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCG2P13521 617 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AP3B2Q13367 1082 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MBTPS1Q14703 1052 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP2W1Q8TAV3 490 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GLG1Q92896 1179 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBED2Q9BTP6 218 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNH7Q9NS40 1196 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EYSQ5T1H1 3165 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TLL1O43897 1013 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LGR5O75473 907 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF76P36508 570 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADGRE1Q14246 886 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCTN1Q2MV58 587 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXL16Q8N461 479 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NRCAMQ92823 1304 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EFCAB14O75071 495 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MARK3P27448 753 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LMBR1Q8WVP7 490 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SDF4Q9BRK5 362 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERAP1Q9NZ08 941 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC9A2Q9UBY0 812 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UNC80Q8N2C7 3258 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTSHP09668 335 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARP10275 920 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SREBF1P36956 1147 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLK2P49760 499 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEFB103AP81534 67 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEP55Q53EZ4 464 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RUFY3Q7L099 469 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP38Q8NB14 1042 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHKBQ93100 1093 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CERS4Q9HA82 394 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C6orf50Q9HD87 102 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAND2O75155 1236 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPFIA1Q13136 1202 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DBF4BQ8NFT6 615 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPRSQ13332 1948 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NID2Q14112 1375 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADAM17P78536 824 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PKN1Q16512 942 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AZI2Q9H6S1 392 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NFASCO94856 1347 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MEIS1O00470 390 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPFIA3O75145 1194 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAP1Q03518 808 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEPT8Q92599 483 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC26A6Q9BXS9 759 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ESYT2A0FGR8 921 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RFXAPO00287 272 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACTR2P61160 394 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRIK4Q16099 956 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCTP2Q6DN12 878 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM117BQ6P1L5 589 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARNTL2Q8WYA1 636 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHD7Q9P2D1 2997 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF15O94989 841 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNA11P29992 359 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EVCP57679 992 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGBP1P78318 339 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NTRK3Q16288 839 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NIPA1Q7RTP0 329 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLA2G4DQ86XP0 818 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MICALL1Q8N3F8 863 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCYT2Q99447 389 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GJB5O95377 273 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AMHP03971 560 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFNAR1P17181 557 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms