RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 SPATC1Q76KD6 591 aa6.51□□□□□ -1.37
UBE2B-202ENST00000499038 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.51□□□□□ -1.37
UBE2B-202ENST00000499038 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
UBE2B-202ENST00000499038 PROSER1Q86XN7 944 aa6.51□□□□□ -1.37
UBE2B-202ENST00000499038 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.51□□□□□ -1.37
UBE2B-202ENST00000499038 DTX3Q8N9I9 347 aa6.51□□□□□ -1.37
UBE2B-202ENST00000499038 MBD6Q96DN6 1003 aa6.51□□□□□ -1.37
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UBE2B-202ENST00000499038 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.51□□□□□ -1.37
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UBE2B-202ENST00000499038 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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UBE2B-202ENST00000499038 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.48□□□□□ -1.37
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UBE2B-202ENST00000499038 ZNF839A8K0R7 811 aa6.46□□□□□ -1.38
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UBE2B-202ENST00000499038 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.46□□□□□ -1.38
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UBE2B-202ENST00000499038 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.45□□□□□ -1.38
UBE2B-202ENST00000499038 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.45□□□□□ -1.38
UBE2B-202ENST00000499038 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.45□□□□□ -1.38
UBE2B-202ENST00000499038 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2B-202ENST00000499038 H0Y858 1186 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2B-202ENST00000499038 ACOT7O00154 380 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2B-202ENST00000499038 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2B-202ENST00000499038 KRT15P19012 456 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2B-202ENST00000499038 ST5P78524 1137 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2B-202ENST00000499038 ICAM4Q14773 271 aa6.44□□□□□ -1.38
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