RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 WHAMMQ8TF30 809 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 GCC1Q96CN9 775 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 HVCN1Q96D96 273 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 ZFP42Q96MM3 310 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 STK31Q9BXU1 1019 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 ACBD3Q9H3P7 528 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 POLKQ9UBT6 870 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 SBF2Q86WG5 1849 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 FLT4P35916 1363 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 TTC34A8MYJ7 566 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 RHOBTB3O94955 611 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 GZMAP12544 262 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 TNFAIP3P21580 790 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 PRKAR1BP31321 381 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 HALP42357 657 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 AMPHP49418 695 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 RCAN1P53805 252 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 RUNX1T1Q06455 604 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 LAPTM5Q13571 262 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 MAP7Q14244 749 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 MFN1Q8IWA4 741 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 ITPRIPQ8IWB1 547 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF606Q8WXB4 792 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 SNX21Q969T3 373 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 MYO6Q9UM54 1294 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 CDC45O75419 566 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 ALDH1L1O75891 902 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 RASGRP1O95267 797 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 APBB3O95704 486 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 CAPNS1P04632 268 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 CYP17A1P05093 508 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 EPB42P16452 691 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 PDE6CP51160 858 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 APBA1Q02410 837 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 LAMB3Q13751 1172 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 DPYSQ14117 519 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 CEP57L1Q8IYX8 460 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 OR52K2Q8NGK3 314 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 ANKRD7Q92527 254 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 SGCDQ92629 289 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 TNIP3Q96KP6 325 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 ALG1Q9BT22 464 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 C12orf49Q9H741 205 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 PARVGQ9HBI0 331 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 GRID1Q9ULK0 1009 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF711Q9Y462 761 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 DISP2A7MBM2 1401 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 INSRP06213 1382 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 DDHD2O94830 711 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP5JP18859 108 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 MTHFRP42898 656 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 STT3AP46977 705 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 DMPKQ09013 629 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-214ENST00000497648 PLCB4Q15147 1175 aa9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms