RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	VWCE	Q96DN2	955 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	ALG2	Q9H553	416 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	GBF1	Q92538	1859 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511		A6NJR5	290 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	KPNA6	O60684	536 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF15	O94989	841 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	ICAM1	P05362	532 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	CALML3	P27482	149 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R2C6	588 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	12.76	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G6	O60733	806 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	PPARA	Q07869	468 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511		B4DLN1	442 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	SCTR	P47872	440 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGIS	Q16647	500 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	GJD3	Q8N144	294 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	MORC4	Q8TE76	937 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	SCFD2	Q8WU76	684 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TOMM22	Q9NS69	142 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	LCHN	A4D1U4	455 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	NFIB	O00712	420 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAK2	O60296	914 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNA5	P22460	613 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC16A2	P36021	539 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRED2	Q7Z698	418 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	CAGE1	Q8TC20	777 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF4	Q8WV16	495 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH4	Q9Y623	1939 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR33	A8MZF0	331 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	NMT2	O60551	498 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	LPXN	O60711	386 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	COPS5	Q92905	334 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	FSD1	Q9BTV5	496 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	ALAD	P13716	330 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	SELP	P16109	830 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB103A	P81534	67 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TREML4	Q6UXN2	200 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST3	Q7LGC8	479 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD9A	Q99638	391 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	CD320	Q9NPF0	282 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	PNMA2	Q9UL42	364 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH7	P12883	1935 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	PIEZO1	Q92508	2521 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	SOBP	A7XYQ1	873 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	EFCAB14	O75071	495 aa		12.71	□□□□□ -0.37

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