RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 ADOQ96SZ5 270 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.06□□□□□ -1.28
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ITGA4-211ENST00000490435 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 FAHP16930 419 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 GLRBP48167 497 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 TGFB2P61812 414 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 TUSC3Q13454 348 aa7.06□□□□□ -1.28
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ITGA4-211ENST00000490435 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 KATNBL1Q9H079 304 aa7.06□□□□□ -1.28
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ITGA4-211ENST00000490435 KCND1Q9NSA2 647 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
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ITGA4-211ENST00000490435 NRN1LQ496H8 165 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 MIIPQ5JXC2 388 aa7.05□□□□□ -1.28
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ITGA4-211ENST00000490435 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 STPG3Q8N7X2 389 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 H0Y858 1186 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 GRIA2P42262 883 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 PFKPQ01813 784 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 VPS37DQ86XT2 251 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 EDAQ92838 391 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.03□□□□□ -1.28
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ITGA4-211ENST00000490435 COMTP21964 271 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 PPP2R2AP63151 447 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 CD276Q5ZPR3 534 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 USP53Q70EK8 1073 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
ITGA4-211ENST00000490435 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.03□□□□□ -1.28
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ITGA4-211ENST00000490435 CAPN10Q9HC96 672 aa7.03□□□□□ -1.28
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ITGA4-211ENST00000490435 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
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ITGA4-211ENST00000490435 ZNF839A8K0R7 811 aa7.01□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 LTFP02788 710 aa7.01□□□□□ -1.29
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ITGA4-211ENST00000490435 DSEQ9UL01 958 aa7.01□□□□□ -1.29
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ITGA4-211ENST00000490435 DLX3O60479 287 aa7□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF202O95125 648 aa7□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 GJB6O95452 261 aa7□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 KIZQ2M2Z5 673 aa7□□□□□ -1.29
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ITGA4-211ENST00000490435 KCNJ15Q99712 375 aa7□□□□□ -1.29
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ITGA4-211ENST00000490435 C11orf21Q9P2W6 132 aa7□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
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ITGA4-211ENST00000490435 RAD17O75943 681 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 IL18BPO95998 194 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 POLD1P28340 1107 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 EPHA5P54756 1037 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 LBX2Q6XYB7 198 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 DCAF4Q8WV16 495 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 MCM7P33993 719 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 ETFBP38117 255 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 PTH1RQ03431 593 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 KCTD1Q719H9 257 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGA4-211ENST00000490435 EXTL1Q92935 676 aa6.98□□□□□ -1.29
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