RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488171.5

CD55-209, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), humanhuman

TSL 3

Gene CD55, Length 1,389 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55-209ENST00000488171 EMSYQ7Z589 1322 aa22.13■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 EPOPA6NHQ4 379 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 MAFGO15525 162 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 TLL1O43897 1013 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 GNAT1P11488 350 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 ADCY7P51828 1080 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 IKBKEQ14164 716 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 CERS4Q9HA82 394 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 MYO9BQ13459 2157 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 SMCO2A6NFE2 343 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 RFXAPO00287 272 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 EFCAB14O75071 495 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 CAND2O75155 1236 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 FGD1P98174 961 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 BRF1Q92994 677 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 ANO3Q9BYT9 981 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.12■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 VCANP13611 3396 aa22.11■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 NID2Q14112 1375 aa22.11■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 LCHNA4D1U4 455 aa22.11■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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CD55-209ENST00000488171 ARHGAP4P98171 946 aa22.11■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.11■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 SPRED2Q7Z698 418 aa22.11■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 FBXL16Q8N461 479 aa22.11■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.11■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 TMEM260Q9NX78 707 aa22.11■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 NRCAMQ92823 1304 aa22.1■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 GJB5O95377 273 aa22.1■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 CTSHP09668 335 aa22.1■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 RPS6KB1P23443 525 aa22.1■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.138e-7■■■■□ 21.2
CD55-209ENST00000488171 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.1■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.09■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 REC8O95072 547 aa22.09■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 ARP10275 920 aa22.09■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 SREBF1P36956 1147 aa22.09■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 AP3B2Q13367 1082 aa22.09■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.09■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 PCYT2Q99447 389 aa22.09■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.09■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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CD55-209ENST00000488171 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.09■■□□□ 1.13
CD55-209ENST00000488171 REV3LO60673 3130 aa22.08■■□□□ 1.13
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CD55-209ENST00000488171 MARK3P27448 753 aa22.08■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 CEP55Q53EZ4 464 aa22.08■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 FAM26DQ5JW98 314 aa22.08■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.08■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 GLG1Q92896 1179 aa22.08■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 RAD9AQ99638 391 aa22.08■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.08■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.08■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.08■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 TRANK1O15050 2925 aa22.07■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 MEIS1O00470 390 aa22.07■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 ADAMTS3O15072 1205 aa22.07■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 PPFIA1Q13136 1202 aa22.07■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 GRIK4Q16099 956 aa22.07■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 PKN1Q16512 942 aa22.07■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.07■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 NFASCO94856 1347 aa22.07■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.06■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.06■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 RPAINQ86UA6 219 aa22.06■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.06■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 SEPT8Q92599 483 aa22.06■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 THEGQ9P2T0 379 aa22.06■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 SIP14410 1827 aa22.06■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 KAT6AQ92794 2004 aa22.06■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 ESYT2A0FGR8 921 aa22.05■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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CD55-209ENST00000488171 PSMA5P28066 241 aa22.05■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 ACTR2P61160 394 aa22.05■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 NTRK3Q16288 839 aa22.05■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.05■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.05■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 KRT40Q6A162 431 aa22.05■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.05■■□□□ 1.12
CD55-209ENST00000488171 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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