RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487591.5

RRM2-208, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-208	ENST00000487591		H3BRB1	525 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	CFB	P00751	764 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	LGALS2	P05162	132 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	HSD17B4	P51659	736 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	ZXDA	P98168	799 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	GHRHR	Q02643	423 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	IL17RA	Q96F46	866 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	ASIC4	Q96FT7	647 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	TTC14	Q96N46	770 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	CD207	Q9UJ71	328 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591		B4DLN1	442 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	ST18	O60284	1047 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	EYA4	O95677	639 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	ITGB1	P05556	798 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	GHR	P10912	638 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MX1	P20591	662 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	GATM	P50440	423 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MGAT3	Q09327	533 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	PGM5	Q15124	567 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	FAM26D	Q5JW98	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	FIBCD1	Q8N539	461 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	CACNA1A	O00555	2505 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	ENPP3	O14638	875 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	GFRA3	O60609	400 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MMP1	P03956	469 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	PTPN5	P54829	565 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	LPIN1	Q14693	890 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	FBXL6	Q8N531	539 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MTMR8	Q96EF0	704 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	CDH22	Q9UJ99	828 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	PNMA2	Q9UL42	364 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	FAM50B	Q9Y247	325 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591		B4E1Z4	1266 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	STK25	O00506	426 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	KDM4A	O75164	1064 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	DGKI	O75912	1065 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	RB1	P06400	928 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	DGKH	Q86XP1	1220 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	GPR20	Q99678	358 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	LAMA4	Q16363	1823 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	ZMYM6	O95789	1325 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591		H0Y858	1186 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	PER2	O15055	1255 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	AVPR2	P30518	371 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	NRIP1	P48552	1158 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	NDUFV1	P49821	464 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	COASY	Q13057	564 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRM2-208	ENST00000487591	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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