RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 SAMD3Q8N6K7 520 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 FAM122AQ96E09 287 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 PCYT2Q99447 389 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 TRIOO75962 3097 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 GRM6O15303 877 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 SGSM2O43147 1006 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 EFCAB14O75071 495 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 GPM6BQ13491 265 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 LPIN1Q14693 890 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 TMEM192Q8IY95 271 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 GJD3Q8N144 294 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 CRIPAKQ8N1N5 446 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 SEPT8Q92599 483 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 EMSYQ7Z589 1322 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 FIBPO43427 364 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 GHRP10912 638 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 ARHGAP4P98171 946 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 AAMPQ13685 434 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 WTAPQ15007 396 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 UBE2SQ16763 222 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 BANK1Q8NDB2 785 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 MAP4K1Q92918 833 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 SPZ1Q9BXG8 430 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 USP26Q9BXU7 913 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 WDFY4Q6ZS81 3184 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 C19orf67A6NJJ6 358 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PIK3CDO00329 1044 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ENPP3O14638 875 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ADAMTS3O15072 1205 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 LINC01565O15544 149 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 DNAJB1P25685 340 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 MARK3P27448 753 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 HYAL1Q12794 435 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 NEDD9Q14511 834 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CTC1Q2NKJ3 1217 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PCNX4Q63HM2 1172 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 SKAP1Q86WV1 359 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ZNF654Q8IZM8 581 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CYP2W1Q8TAV3 490 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 YME1L1Q96TA2 773 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 SENP7Q9BQF6 1050 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PKD2L1Q9P0L9 805 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CAND2O75155 1236 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 GATMP50440 423 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ZP2Q05996 745 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 RPAINQ86UA6 219 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 NCOA7Q8NI08 942 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 DNAJB3Q8WWF6 145 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 LRRC2Q9BYS8 371 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 C5orf67F2Z3F1 127 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 NOP56O00567 594 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TBX10O75333 385 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 STAM2O75886 525 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CSPG5O95196 566 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 BMPR1AP36894 532 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CLUL1Q15846 466 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 GNPTABQ3T906 1256 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 FBXO47Q5MNV8 452 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PGBD1Q96JS3 809 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CDY2AQ9Y6F7 541 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TTC3P53804 2025 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ZNF318Q5VUA4 2279 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TECTAO75443 2155 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 NLRC5Q86WI3 1866 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PRC1O43663 620 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CD52P31358 61 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 IRS1P35568 1242 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TRDNQ13061 729 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 PPFIA1Q13136 1202 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 GRIK4Q16099 956 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CATIPQ7Z7H3 387 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 IL17RAQ96F46 866 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 SAMD11Q96NU1 681 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 MAP3K14Q99558 947 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 TMX1Q9H3N1 280 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-206ENST00000474188 NRCAMQ92823 1304 aa12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms