RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 PDXDC2PQ6P474 469 aa15.32■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.32■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 MMGT1Q8N4V1 131 aa15.32■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.32■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 GSDMAQ96QA5 445 aa15.32■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 VCPKMTQ9H867 229 aa15.32■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.32■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 TXKP42681 527 aa15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 RUBCNQ92622 972 aa15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 GJA3Q9Y6H8 435 aa15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 LONP1P36776 959 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 CCDC40Q4G0X9 1142 aa15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 EPN3Q9H201 632 aa15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 PSTPIP2Q9H939 334 aa15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 CTNND2Q9UQB3 1225 aa15.31■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 ESYT2A0FGR8 921 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 ANO9A1A5B4 782 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 OR52Z1P0C646 297 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 PLCB4Q15147 1175 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 NAALADL2Q58DX5 795 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 NAA35Q5VZE5 725 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 AGBL3Q8NEM8 1001 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 KRT86O43790 486 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 LSP1P33241 339 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 UBA7P41226 1012 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 STAT6P42226 847 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 MTMR8Q96EF0 704 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 LRRC1Q9BTT6 524 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 KCNG1Q9UIX4 513 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 KRT83P78385 493 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 SPAG1Q07617 926 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 DCAF4Q8WV16 495 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 EEF2KMTQ96G04 330 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 FAXDC2Q96IV6 333 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 RUFY1Q96T51 708 aa15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 TTC26A0AVF1 554 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 HSF2BPO75031 334 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 ATP1A2P50993 1020 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 EMBQ6PCB8 327 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 CCDC13Q8IYE1 715 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 CUL5Q93034 780 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 DNAJC7Q99615 494 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 DISC1Q9NRI5 854 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 BMP3P12645 472 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 EPHB4P54760 987 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 EMC10Q5UCC4 262 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 WDR59Q6PJI9 974 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 KDM7AQ6ZMT4 941 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 JADE2Q9NQC1 790 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 GGA2Q9UJY4 613 aa15.29■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 ITIH3Q06033 890 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 NNTQ13423 1086 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 DGKZQ13574 1117 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 RASA3Q14644 834 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 PPP2R5AQ15172 486 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 CEP85LQ5SZL2 805 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 LRCH2Q5VUJ6 765 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 KIAA1328Q86T90 577 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 CREG2Q8IUH2 290 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 SH2D3CQ8N5H7 860 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 CEP120Q8N960 986 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 POTEMA6NI47 508 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 IDEP14735 1019 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 UBXN1Q04323 297 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 CAVIN3Q969G5 261 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 SLC40A1Q9NP59 571 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 FZD1Q9UP38 647 aa15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.27■□□□□ 0.04
GPC1-208ENST00000469694 RCCD1A6NED2 376 aa15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms