RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466539.1

PSME4-204, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene PSME4, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-204ENST00000466539 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 DBNDD1Q9H9R9 158 aa7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 ABCF2Q9UG63 623 aa7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.3□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 MYH8P13535 1937 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 PPIP5K2O43314 1243 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 PRKAB2O43741 272 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 PF4P02776 101 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 LDHCP07864 332 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 BMP3P12645 472 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 NOVP48745 357 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 CXCL9Q07325 125 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 KRT32Q14532 448 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 RUFY3Q7L099 469 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 DYMQ7RTS9 669 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 DPF2Q92785 391 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 RHOVQ96L33 236 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 MYRFLQ96LU7 910 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 IDI2Q9BXS1 227 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 ARMT1Q9H993 441 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 DISC1Q9NRI5 854 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 RAI14Q9P0K7 980 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 PGAP2Q9UHJ9 254 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 GGT7Q9UJ14 662 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 CSADQ9Y600 493 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 NID2Q14112 1375 aa7.29□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 E7EWF7 191 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 PSMD14O00487 310 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 SLFN14P0C7P3 912 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 GARTP22102 1010 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 RPS6KB1P23443 525 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 MCCP23508 829 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 RPS12P25398 132 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 ITGB7P26010 798 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 ANTXR2P58335 489 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 GABPAQ06546 454 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 C12orf60Q5U649 245 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 FKBP1CQ5VVH2 108 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 CTR9Q6PD62 1173 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 C12orf40Q86WS4 652 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 TBC1D10CQ8IV04 446 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 TMEM74Q96NL1 305 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 SCN4AP35499 1836 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 PLIN4Q96Q06 1357 aa7.28□□□□□ -1.24
PSME4-204ENST00000466539 WDR90Q96KV7 1748 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ORC4O43929 436 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ZNF76P36508 570 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 BTDP43251 543 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 MCM2P49736 904 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ID3Q02535 119 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 RING1Q06587 406 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ST3GAL1Q11201 340 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ZNF394Q53GI3 561 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 RELL1Q8IUW5 271 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms