RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 POTEGQ6S5H5 508 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 CETN3O15182 167 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 RNF40O75150 1001 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 AMNQ9BXJ7 453 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 MEIS2O14770 477 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 MYBL2P10244 700 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ACTN2P35609 894 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 SLC12A3P55017 1021 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ICA1Q05084 483 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 MCTP2Q6DN12 878 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 PODNQ7Z5L7 613 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 RUBCNQ92622 972 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 TSKSQ9UJT2 592 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 NR2F2P24468 414 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 MBOAT7Q96N66 472 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 DNM3Q9UQ16 869 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 NCK2O43639 380 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 TLR2O60603 784 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM37O94972 964 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ARID5AQ03989 594 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 USH1GQ495M9 461 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ARSHQ5FYA8 562 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 PDE6BP35913 854 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 TBX3O15119 743 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 KCNH2Q12809 1159 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 FBXO11Q86XK2 927 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 TBC1D5Q92609 795 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 HINFPQ9BQA5 517 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 TLR10Q9BXR5 811 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 F5H6K3 240 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 MEIS1O00470 390 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 KLRC3Q07444 240 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 SLC18A3Q16572 532 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 STK24Q9Y6E0 443 aa20.16■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 RPA1P27694 616 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 SNAP25P60880 206 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 APBA1Q02410 837 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 Q4G0T1 1027 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 GGCXP38435 758 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 GIT2Q14161 759 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 ASIC2Q16515 512 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 C8orf74Q6P047 294 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 MASTLQ96GX5 879 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 IDI2Q9BXS1 227 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 RNF14Q9UBS8 474 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 MYH10P35580 1976 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 GDF11O95390 407 aa20.14■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
SYNE4-204ENST00000465425 CASP5P51878 434 aa20.14■□□□□ 0.82
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