RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464280.5

NISCH-204, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 3

Gene NISCH, Length 833 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-204ENST00000464280 GNAT1P11488 350 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 CSF2RAP15509 400 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 KRT25Q7Z3Z0 450 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 RETREG2Q8NC44 543 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 TBCKQ8TEA7 893 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 ZNF577Q9BSK1 485 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 AZI2Q9H6S1 392 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 BRMS1Q9HCU9 246 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 TBC1D22BQ9NU19 505 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 ERAP1Q9NZ08 941 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 KCNJ14Q9UNX9 436 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 TET1Q8NFU7 2136 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 UMODL1Q5DID0 1318 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 EMSYQ7Z589 1322 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 C17orf102A2RUQ5 167 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 FDPSP14324 419 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 CCL23P55773 120 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 PTK7Q13308 1070 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 TRIM29Q14134 588 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 SHHQ15465 462 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 NPY5RQ15761 445 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 PRR16Q569H4 304 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 GLG1Q92896 1179 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 WNT8AQ9H1J5 351 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 IL23AQ9NPF7 189 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 PARNO95453 639 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 RFC2P35250 354 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 KRT2P35908 639 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 EPHB4P54760 987 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 ACTR2P61160 394 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 C9orf50Q5SZB4 431 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 MOXD1Q6UVY6 613 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 TRIM50Q86XT4 487 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 CCDC83Q8IWF9 413 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 AFAP1L1Q8TED9 768 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 ATP6V0A1Q93050 837 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 RNPEPQ9H4A4 650 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 TELO2Q9Y4R8 837 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 NRCAMQ92823 1304 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 DHX15O43143 795 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 JAK2O60674 1132 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 LGR5O75473 907 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 ATG7O95352 703 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 PFKMP08237 780 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 IQCF3P0C7M6 154 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 CYP3A7P24462 503 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 HOXC8P31273 242 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 KRT76Q01546 638 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 RBL2Q08999 1139 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 Q4G0T1 1027 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 TMEM240Q5SV17 173 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 LENG9Q96B70 501 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 SCLYQ96I15 445 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 CTAGE1Q96RT6 745 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP13.22□□□□□ -0.292e-7■□□□□ 10.9
NISCH-204ENST00000464280 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 GJB4Q9NTQ9 266 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 SIP14410 1827 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 DTNBO60941 627 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 FGBP02675 491 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 MMP1P03956 469 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 ACRP10323 421 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 CKBP12277 381 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 SELPP16109 830 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 MARK3P27448 753 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 SLC26A2P50443 739 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 STAT5BP51692 787 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 ST3GAL1Q11201 340 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 INF2Q27J81 1249 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 FAM160B1Q5W0V3 765 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 GPR153Q6NV75 609 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 ZNF365Q70YC5 407 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 C16orf59Q7L2K0 433 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 NEK8Q86SG6 692 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 SERINC5Q86VE9 423 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-204ENST00000464280 RIT2Q99578 217 aa13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms