RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463022.1

SP110-208, Transcript of SP110 nuclear body protein, human

TSL 2

Gene SP110, Length 405 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SP110-208	ENST00000463022	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	DEXI	O95424	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GGPS1	O95749	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TIMP1	P01033	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SREBF1	P36956	1147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MMRN1	Q13201	1228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PKN1	Q16512	942 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PACS2	Q86VP3	889 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	COPS5	Q92905	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	HAS3	O00219	553 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MEIS1	O00470	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TRIM66	O15016	1216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	F2	P00734	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MYL3	P08590	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CYP3A4	P08684	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RAG1	P15918	1043 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SYN1	P17600	705 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	XBP1	P17861	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ITGB5	P18084	799 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PTGS1	P23219	599 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	AK2	P54819	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SP2	Q02086	613 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RBL2	Q08999	1139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MTMR1	Q13613	665 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	UBE2S	Q16763	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	WASF1	Q92558	559 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	KAT2B	Q92831	832 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PHKB	Q93100	1093 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NFASC	O94856	1347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022		M0R2N6	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	B4GALT4	O60513	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	LGALS2	P05162	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PFKM	P08237	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	KCNA2	P16389	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	HOXC8	P31273	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CIITA	P33076	1130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RFC2	P35250	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	USP11	P51784	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NEK4	P51957	841 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NLRP5	P59047	1200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PSMC6	P62333	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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