RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 GDF15Q99988 308 aa23.31■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.31■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 TBX21Q9UL17 535 aa23.31■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 CEP290O15078 2479 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 ACTR2P61160 394 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 INF2Q27J81 1249 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 MFSD5Q6N075 450 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 BADQ92934 168 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 BACH1O14867 736 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 GAS7O60861 476 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 FPGSQ05932 587 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.321e-7■■□□□ 11.7
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IMP4-209ENST00000462357 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 CAGE1Q8TC20 777 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 SAMM50Q9Y512 469 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 PSAPP07602 524 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 SFNP31947 248 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 STAT5BP51692 787 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 FAM20AQ96MK3 541 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 NRCAMQ92823 1304 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 ADAMTS3O15072 1205 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 PTK7Q13308 1070 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 EMSYQ7Z589 1322 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-209ENST00000462357 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 WDR64B1ANS9 1081 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 BTBD18B2RXH4 712 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 PITPNM1O00562 1244 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 TBX3O15119 743 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 LGR5O75473 907 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 ATG7O95352 703 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 JAK3P52333 1124 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 ST3GAL1Q11201 340 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 OXER1Q8TDS5 423 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 H3BQV1 296 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 MSH4O15457 936 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 RFC2P35250 354 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 FOSBP53539 338 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 NR5A1Q13285 461 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 TDHQ8IZJ6 230 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 RDM1Q8NG50 284 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 SLC5A5Q92911 643 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
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IMP4-209ENST00000462357 ZNF302Q9NR11 478 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
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IMP4-209ENST00000462357 PFKMP08237 780 aa23.24■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 CYP2C9P11712 490 aa23.24■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.24■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 RSPH3Q86UC2 560 aa23.24■■□□□ 1.31
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IMP4-209ENST00000462357 MBOAT7Q96N66 472 aa23.24■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 TRPC6Q9Y210 931 aa23.24■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 DTNBO60941 627 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 TDP2O95551 362 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 GUCY1B3Q02153 619 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 PPFIA1Q13136 1202 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 LENG9Q96B70 501 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 DISC1Q9NRI5 854 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-209ENST00000462357 CAND2O75155 1236 aa23.22■■□□□ 1.31
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